Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHD4

Frmd3, FERM domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd3Q8BHD4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Frmd3Q8BHD4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Frmd3Q8BHD4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Frmd3Q8BHD4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Frmd3Q8BHD4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Frmd3Q8BHD4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Frmd3Q8BHD4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Frmd3Q8BHD4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Frmd3Q8BHD4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Frmd3Q8BHD4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Frmd3Q8BHD4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Frmd3Q8BHD4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Frmd3Q8BHD4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Frmd3Q8BHD4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Frmd3Q8BHD4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Frmd3Q8BHD4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Frmd3Q8BHD4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Frmd3Q8BHD4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Frmd3Q8BHD4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Frmd3Q8BHD4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Frmd3Q8BHD4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Frmd3Q8BHD4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Frmd3Q8BHD4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Frmd3Q8BHD4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Frmd3Q8BHD4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Frmd3Q8BHD4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Frmd3Q8BHD4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Frmd3Q8BHD4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Frmd3Q8BHD4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Frmd3Q8BHD4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Frmd3Q8BHD4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Frmd3Q8BHD4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Frmd3Q8BHD4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Frmd3Q8BHD4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Frmd3Q8BHD4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Frmd3Q8BHD4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Frmd3Q8BHD4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Frmd3Q8BHD4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Frmd3Q8BHD4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Frmd3Q8BHD4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Frmd3Q8BHD4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Frmd3Q8BHD4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Frmd3Q8BHD4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Frmd3Q8BHD4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Frmd3Q8BHD4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Frmd3Q8BHD4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Frmd3Q8BHD4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Frmd3Q8BHD4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Frmd3Q8BHD4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Frmd3Q8BHD4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Frmd3Q8BHD4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Frmd3Q8BHD4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Frmd3Q8BHD4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Frmd3Q8BHD4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Frmd3Q8BHD4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Frmd3Q8BHD4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Frmd3Q8BHD4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Frmd3Q8BHD4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Frmd3Q8BHD4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Frmd3Q8BHD4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Frmd3Q8BHD4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Frmd3Q8BHD4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Frmd3Q8BHD4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Frmd3Q8BHD4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Frmd3Q8BHD4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Frmd3Q8BHD4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Frmd3Q8BHD4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Frmd3Q8BHD4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Frmd3Q8BHD4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Frmd3Q8BHD4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Frmd3Q8BHD4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Frmd3Q8BHD4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Frmd3Q8BHD4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Frmd3Q8BHD4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Frmd3Q8BHD4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Frmd3Q8BHD4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Frmd3Q8BHD4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Frmd3Q8BHD4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Frmd3Q8BHD4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Frmd3Q8BHD4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Frmd3Q8BHD4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Frmd3Q8BHD4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Frmd3Q8BHD4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Frmd3Q8BHD4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Frmd3Q8BHD4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Frmd3Q8BHD4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Frmd3Q8BHD4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Frmd3Q8BHD4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Frmd3Q8BHD4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Frmd3Q8BHD4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Frmd3Q8BHD4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Frmd3Q8BHD4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Frmd3Q8BHD4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Frmd3Q8BHD4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Frmd3Q8BHD4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Frmd3Q8BHD4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmd3Q8BHD4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmd3Q8BHD4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmd3Q8BHD4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmd3Q8BHD4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 197 ms