Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH48

Ubap1, Ubiquitin-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubap1Q8BH48 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubap1Q8BH48 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubap1Q8BH48 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ubap1Q8BH48 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubap1Q8BH48 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubap1Q8BH48 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubap1Q8BH48 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubap1Q8BH48 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubap1Q8BH48 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubap1Q8BH48 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ubap1Q8BH48 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubap1Q8BH48 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubap1Q8BH48 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubap1Q8BH48 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ubap1Q8BH48 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubap1Q8BH48 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubap1Q8BH48 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ubap1Q8BH48 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubap1Q8BH48 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubap1Q8BH48 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubap1Q8BH48 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubap1Q8BH48 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubap1Q8BH48 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubap1Q8BH48 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubap1Q8BH48 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubap1Q8BH48 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ubap1Q8BH48 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubap1Q8BH48 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubap1Q8BH48 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubap1Q8BH48 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubap1Q8BH48 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubap1Q8BH48 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ubap1Q8BH48 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ubap1Q8BH48 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ubap1Q8BH48 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ubap1Q8BH48 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ubap1Q8BH48 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ubap1Q8BH48 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ubap1Q8BH48 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ubap1Q8BH48 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ubap1Q8BH48 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ubap1Q8BH48 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ubap1Q8BH48 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubap1Q8BH48 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubap1Q8BH48 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubap1Q8BH48 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubap1Q8BH48 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubap1Q8BH48 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubap1Q8BH48 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubap1Q8BH48 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubap1Q8BH48 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubap1Q8BH48 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubap1Q8BH48 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubap1Q8BH48 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubap1Q8BH48 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubap1Q8BH48 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubap1Q8BH48 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubap1Q8BH48 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubap1Q8BH48 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubap1Q8BH48 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubap1Q8BH48 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubap1Q8BH48 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubap1Q8BH48 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubap1Q8BH48 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubap1Q8BH48 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubap1Q8BH48 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubap1Q8BH48 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ubap1Q8BH48 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubap1Q8BH48 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubap1Q8BH48 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubap1Q8BH48 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubap1Q8BH48 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubap1Q8BH48 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubap1Q8BH48 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubap1Q8BH48 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubap1Q8BH48 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubap1Q8BH48 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubap1Q8BH48 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubap1Q8BH48 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubap1Q8BH48 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubap1Q8BH48 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubap1Q8BH48 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubap1Q8BH48 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubap1Q8BH48 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubap1Q8BH48 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubap1Q8BH48 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubap1Q8BH48 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubap1Q8BH48 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubap1Q8BH48 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ubap1Q8BH48 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ubap1Q8BH48 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ubap1Q8BH48 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ubap1Q8BH48 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ubap1Q8BH48 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ubap1Q8BH48 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ubap1Q8BH48 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ubap1Q8BH48 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubap1Q8BH48 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubap1Q8BH48 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubap1Q8BH48 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms