Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Best2Q8BGM5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Best2Q8BGM5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Best2Q8BGM5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Best2Q8BGM5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Best2Q8BGM5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Best2Q8BGM5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Best2Q8BGM5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Best2Q8BGM5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Best2Q8BGM5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Best2Q8BGM5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Best2Q8BGM5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Best2Q8BGM5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Best2Q8BGM5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Best2Q8BGM5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Best2Q8BGM5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Best2Q8BGM5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Best2Q8BGM5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Best2Q8BGM5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Best2Q8BGM5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Best2Q8BGM5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Best2Q8BGM5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Best2Q8BGM5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Best2Q8BGM5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Best2Q8BGM5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Best2Q8BGM5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Best2Q8BGM5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Best2Q8BGM5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Best2Q8BGM5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Best2Q8BGM5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Best2Q8BGM5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Best2Q8BGM5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Best2Q8BGM5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Best2Q8BGM5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Best2Q8BGM5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Best2Q8BGM5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Best2Q8BGM5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Best2Q8BGM5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Best2Q8BGM5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Best2Q8BGM5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Best2Q8BGM5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Best2Q8BGM5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Best2Q8BGM5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Best2Q8BGM5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Best2Q8BGM5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Best2Q8BGM5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Best2Q8BGM5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Best2Q8BGM5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Best2Q8BGM5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Best2Q8BGM5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Best2Q8BGM5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Best2Q8BGM5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Best2Q8BGM5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Best2Q8BGM5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Best2Q8BGM5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Best2Q8BGM5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Best2Q8BGM5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Best2Q8BGM5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Best2Q8BGM5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Best2Q8BGM5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Best2Q8BGM5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Best2Q8BGM5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Best2Q8BGM5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Best2Q8BGM5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Best2Q8BGM5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Best2Q8BGM5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Best2Q8BGM5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Best2Q8BGM5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Best2Q8BGM5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Best2Q8BGM5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Best2Q8BGM5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Best2Q8BGM5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Best2Q8BGM5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Best2Q8BGM5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Best2Q8BGM5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Best2Q8BGM5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Best2Q8BGM5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Best2Q8BGM5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Best2Q8BGM5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Best2Q8BGM5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Best2Q8BGM5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Best2Q8BGM5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Best2Q8BGM5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Best2Q8BGM5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Best2Q8BGM5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Best2Q8BGM5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Best2Q8BGM5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Best2Q8BGM5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Best2Q8BGM5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Best2Q8BGM5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Best2Q8BGM5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Best2Q8BGM5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Best2Q8BGM5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Best2Q8BGM5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Best2Q8BGM5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Best2Q8BGM5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Best2Q8BGM5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Best2Q8BGM5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Best2Q8BGM5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Best2Q8BGM5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms