Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGI4

Fam13a, Protein FAM13A, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam13aQ8BGI4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fam13aQ8BGI4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Fam13aQ8BGI4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fam13aQ8BGI4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fam13aQ8BGI4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fam13aQ8BGI4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fam13aQ8BGI4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fam13aQ8BGI4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fam13aQ8BGI4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fam13aQ8BGI4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Fam13aQ8BGI4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Fam13aQ8BGI4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Fam13aQ8BGI4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Fam13aQ8BGI4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Fam13aQ8BGI4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Fam13aQ8BGI4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fam13aQ8BGI4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fam13aQ8BGI4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fam13aQ8BGI4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Fam13aQ8BGI4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Fam13aQ8BGI4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Fam13aQ8BGI4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fam13aQ8BGI4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fam13aQ8BGI4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fam13aQ8BGI4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fam13aQ8BGI4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fam13aQ8BGI4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fam13aQ8BGI4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fam13aQ8BGI4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fam13aQ8BGI4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fam13aQ8BGI4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fam13aQ8BGI4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fam13aQ8BGI4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fam13aQ8BGI4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Fam13aQ8BGI4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fam13aQ8BGI4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Fam13aQ8BGI4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fam13aQ8BGI4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fam13aQ8BGI4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fam13aQ8BGI4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fam13aQ8BGI4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fam13aQ8BGI4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fam13aQ8BGI4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fam13aQ8BGI4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fam13aQ8BGI4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Fam13aQ8BGI4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Fam13aQ8BGI4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Fam13aQ8BGI4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Fam13aQ8BGI4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Fam13aQ8BGI4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Fam13aQ8BGI4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Fam13aQ8BGI4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Fam13aQ8BGI4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Fam13aQ8BGI4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Fam13aQ8BGI4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Fam13aQ8BGI4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fam13aQ8BGI4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fam13aQ8BGI4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fam13aQ8BGI4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fam13aQ8BGI4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fam13aQ8BGI4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fam13aQ8BGI4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fam13aQ8BGI4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fam13aQ8BGI4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fam13aQ8BGI4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fam13aQ8BGI4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fam13aQ8BGI4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fam13aQ8BGI4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Fam13aQ8BGI4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Fam13aQ8BGI4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Fam13aQ8BGI4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fam13aQ8BGI4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fam13aQ8BGI4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fam13aQ8BGI4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fam13aQ8BGI4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fam13aQ8BGI4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fam13aQ8BGI4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fam13aQ8BGI4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fam13aQ8BGI4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fam13aQ8BGI4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Fam13aQ8BGI4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Fam13aQ8BGI4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Fam13aQ8BGI4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Fam13aQ8BGI4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Fam13aQ8BGI4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fam13aQ8BGI4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fam13aQ8BGI4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fam13aQ8BGI4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fam13aQ8BGI4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fam13aQ8BGI4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fam13aQ8BGI4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Fam13aQ8BGI4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fam13aQ8BGI4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fam13aQ8BGI4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fam13aQ8BGI4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fam13aQ8BGI4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Fam13aQ8BGI4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Fam13aQ8BGI4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Fam13aQ8BGI4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Fam13aQ8BGI4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.7 ms