Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Htatsf1Q8BGC0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Htatsf1Q8BGC0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Htatsf1Q8BGC0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Htatsf1Q8BGC0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Htatsf1Q8BGC0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Htatsf1Q8BGC0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Htatsf1Q8BGC0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Htatsf1Q8BGC0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Htatsf1Q8BGC0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Htatsf1Q8BGC0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Htatsf1Q8BGC0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Htatsf1Q8BGC0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Htatsf1Q8BGC0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Htatsf1Q8BGC0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Htatsf1Q8BGC0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Htatsf1Q8BGC0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Htatsf1Q8BGC0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Htatsf1Q8BGC0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Htatsf1Q8BGC0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Htatsf1Q8BGC0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Htatsf1Q8BGC0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Htatsf1Q8BGC0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Htatsf1Q8BGC0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Htatsf1Q8BGC0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Htatsf1Q8BGC0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Htatsf1Q8BGC0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Htatsf1Q8BGC0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Htatsf1Q8BGC0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Htatsf1Q8BGC0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Htatsf1Q8BGC0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Htatsf1Q8BGC0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Htatsf1Q8BGC0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Htatsf1Q8BGC0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Htatsf1Q8BGC0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Htatsf1Q8BGC0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Htatsf1Q8BGC0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Htatsf1Q8BGC0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Htatsf1Q8BGC0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Htatsf1Q8BGC0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Htatsf1Q8BGC0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Htatsf1Q8BGC0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Htatsf1Q8BGC0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Htatsf1Q8BGC0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Htatsf1Q8BGC0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Htatsf1Q8BGC0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Htatsf1Q8BGC0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Htatsf1Q8BGC0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Htatsf1Q8BGC0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Htatsf1Q8BGC0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Htatsf1Q8BGC0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Htatsf1Q8BGC0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Htatsf1Q8BGC0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Htatsf1Q8BGC0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Htatsf1Q8BGC0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Htatsf1Q8BGC0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Htatsf1Q8BGC0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Htatsf1Q8BGC0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Htatsf1Q8BGC0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Htatsf1Q8BGC0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Htatsf1Q8BGC0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Htatsf1Q8BGC0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Htatsf1Q8BGC0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Htatsf1Q8BGC0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Htatsf1Q8BGC0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Htatsf1Q8BGC0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Htatsf1Q8BGC0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Htatsf1Q8BGC0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Htatsf1Q8BGC0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Htatsf1Q8BGC0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Htatsf1Q8BGC0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Htatsf1Q8BGC0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Htatsf1Q8BGC0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Htatsf1Q8BGC0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Htatsf1Q8BGC0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Htatsf1Q8BGC0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Htatsf1Q8BGC0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Htatsf1Q8BGC0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Htatsf1Q8BGC0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Htatsf1Q8BGC0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Htatsf1Q8BGC0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Htatsf1Q8BGC0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Htatsf1Q8BGC0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Htatsf1Q8BGC0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Htatsf1Q8BGC0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Htatsf1Q8BGC0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Htatsf1Q8BGC0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Htatsf1Q8BGC0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Htatsf1Q8BGC0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Htatsf1Q8BGC0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Htatsf1Q8BGC0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Htatsf1Q8BGC0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Htatsf1Q8BGC0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Htatsf1Q8BGC0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Htatsf1Q8BGC0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Htatsf1Q8BGC0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Htatsf1Q8BGC0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Htatsf1Q8BGC0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Htatsf1Q8BGC0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Htatsf1Q8BGC0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms