Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrtm2Q8BGA3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrtm2Q8BGA3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrtm2Q8BGA3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrtm2Q8BGA3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrtm2Q8BGA3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrtm2Q8BGA3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrtm2Q8BGA3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrtm2Q8BGA3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrtm2Q8BGA3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrtm2Q8BGA3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrtm2Q8BGA3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrtm2Q8BGA3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrtm2Q8BGA3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrtm2Q8BGA3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrtm2Q8BGA3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrtm2Q8BGA3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrtm2Q8BGA3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrtm2Q8BGA3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrtm2Q8BGA3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrtm2Q8BGA3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrtm2Q8BGA3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrtm2Q8BGA3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrtm2Q8BGA3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrtm2Q8BGA3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrtm2Q8BGA3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrtm2Q8BGA3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrtm2Q8BGA3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrtm2Q8BGA3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrtm2Q8BGA3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrtm2Q8BGA3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrtm2Q8BGA3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrtm2Q8BGA3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrtm2Q8BGA3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrtm2Q8BGA3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrtm2Q8BGA3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrtm2Q8BGA3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrtm2Q8BGA3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrtm2Q8BGA3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrtm2Q8BGA3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrtm2Q8BGA3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrtm2Q8BGA3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrtm2Q8BGA3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrtm2Q8BGA3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrtm2Q8BGA3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrtm2Q8BGA3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrtm2Q8BGA3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrtm2Q8BGA3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrtm2Q8BGA3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrtm2Q8BGA3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrtm2Q8BGA3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrtm2Q8BGA3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrtm2Q8BGA3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrtm2Q8BGA3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrtm2Q8BGA3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrtm2Q8BGA3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrtm2Q8BGA3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrtm2Q8BGA3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrtm2Q8BGA3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrtm2Q8BGA3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrtm2Q8BGA3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrtm2Q8BGA3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrtm2Q8BGA3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrtm2Q8BGA3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrtm2Q8BGA3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrtm2Q8BGA3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrtm2Q8BGA3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrtm2Q8BGA3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrrtm2Q8BGA3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrrtm2Q8BGA3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrtm2Q8BGA3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrtm2Q8BGA3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrtm2Q8BGA3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrtm2Q8BGA3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrtm2Q8BGA3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrtm2Q8BGA3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrtm2Q8BGA3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrtm2Q8BGA3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrtm2Q8BGA3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrtm2Q8BGA3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrtm2Q8BGA3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrtm2Q8BGA3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms