Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trmt12Q8BG71 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trmt12Q8BG71 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trmt12Q8BG71 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trmt12Q8BG71 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trmt12Q8BG71 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trmt12Q8BG71 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trmt12Q8BG71 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trmt12Q8BG71 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trmt12Q8BG71 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trmt12Q8BG71 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trmt12Q8BG71 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trmt12Q8BG71 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trmt12Q8BG71 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trmt12Q8BG71 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trmt12Q8BG71 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Trmt12Q8BG71 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Trmt12Q8BG71 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trmt12Q8BG71 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Trmt12Q8BG71 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trmt12Q8BG71 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trmt12Q8BG71 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trmt12Q8BG71 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Trmt12Q8BG71 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trmt12Q8BG71 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trmt12Q8BG71 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trmt12Q8BG71 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trmt12Q8BG71 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trmt12Q8BG71 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trmt12Q8BG71 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trmt12Q8BG71 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trmt12Q8BG71 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trmt12Q8BG71 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trmt12Q8BG71 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trmt12Q8BG71 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trmt12Q8BG71 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trmt12Q8BG71 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trmt12Q8BG71 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trmt12Q8BG71 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trmt12Q8BG71 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trmt12Q8BG71 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Trmt12Q8BG71 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Trmt12Q8BG71 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trmt12Q8BG71 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Trmt12Q8BG71 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trmt12Q8BG71 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trmt12Q8BG71 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trmt12Q8BG71 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trmt12Q8BG71 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trmt12Q8BG71 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trmt12Q8BG71 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trmt12Q8BG71 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trmt12Q8BG71 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trmt12Q8BG71 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trmt12Q8BG71 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trmt12Q8BG71 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trmt12Q8BG71 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trmt12Q8BG71 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trmt12Q8BG71 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trmt12Q8BG71 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trmt12Q8BG71 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trmt12Q8BG71 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trmt12Q8BG71 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trmt12Q8BG71 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trmt12Q8BG71 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trmt12Q8BG71 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trmt12Q8BG71 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trmt12Q8BG71 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trmt12Q8BG71 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trmt12Q8BG71 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Trmt12Q8BG71 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trmt12Q8BG71 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trmt12Q8BG71 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trmt12Q8BG71 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trmt12Q8BG71 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trmt12Q8BG71 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trmt12Q8BG71 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trmt12Q8BG71 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trmt12Q8BG71 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trmt12Q8BG71 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trmt12Q8BG71 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trmt12Q8BG71 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trmt12Q8BG71 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trmt12Q8BG71 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trmt12Q8BG71 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Trmt12Q8BG71 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trmt12Q8BG71 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trmt12Q8BG71 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trmt12Q8BG71 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trmt12Q8BG71 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trmt12Q8BG71 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trmt12Q8BG71 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trmt12Q8BG71 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Trmt12Q8BG71 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trmt12Q8BG71 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trmt12Q8BG71 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trmt12Q8BG71 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trmt12Q8BG71 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trmt12Q8BG71 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trmt12Q8BG71 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms