Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG18

Necab1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab1Q8BG18 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Necab1Q8BG18 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Necab1Q8BG18 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Necab1Q8BG18 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Necab1Q8BG18 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Necab1Q8BG18 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Necab1Q8BG18 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Necab1Q8BG18 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Necab1Q8BG18 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Necab1Q8BG18 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Necab1Q8BG18 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Necab1Q8BG18 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Necab1Q8BG18 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Necab1Q8BG18 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Necab1Q8BG18 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Necab1Q8BG18 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Necab1Q8BG18 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Necab1Q8BG18 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Necab1Q8BG18 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Necab1Q8BG18 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Necab1Q8BG18 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Necab1Q8BG18 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Necab1Q8BG18 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Necab1Q8BG18 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Necab1Q8BG18 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Necab1Q8BG18 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Necab1Q8BG18 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Necab1Q8BG18 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Necab1Q8BG18 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Necab1Q8BG18 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Necab1Q8BG18 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Necab1Q8BG18 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Necab1Q8BG18 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Necab1Q8BG18 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Necab1Q8BG18 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Necab1Q8BG18 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Necab1Q8BG18 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Necab1Q8BG18 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Necab1Q8BG18 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Necab1Q8BG18 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Necab1Q8BG18 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Necab1Q8BG18 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Necab1Q8BG18 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Necab1Q8BG18 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Necab1Q8BG18 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Necab1Q8BG18 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Necab1Q8BG18 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Necab1Q8BG18 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Necab1Q8BG18 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Necab1Q8BG18 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Necab1Q8BG18 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Necab1Q8BG18 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Necab1Q8BG18 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Necab1Q8BG18 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Necab1Q8BG18 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Necab1Q8BG18 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Necab1Q8BG18 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Necab1Q8BG18 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Necab1Q8BG18 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Necab1Q8BG18 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Necab1Q8BG18 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Necab1Q8BG18 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Necab1Q8BG18 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Necab1Q8BG18 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Necab1Q8BG18 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Necab1Q8BG18 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Necab1Q8BG18 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Necab1Q8BG18 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Necab1Q8BG18 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Necab1Q8BG18 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Necab1Q8BG18 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Necab1Q8BG18 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Necab1Q8BG18 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Necab1Q8BG18 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Necab1Q8BG18 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Necab1Q8BG18 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Necab1Q8BG18 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Necab1Q8BG18 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Necab1Q8BG18 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Necab1Q8BG18 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Necab1Q8BG18 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Necab1Q8BG18 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Necab1Q8BG18 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Necab1Q8BG18 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Necab1Q8BG18 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Necab1Q8BG18 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Necab1Q8BG18 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Necab1Q8BG18 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Necab1Q8BG18 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Necab1Q8BG18 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Necab1Q8BG18 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Necab1Q8BG18 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Necab1Q8BG18 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Necab1Q8BG18 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Necab1Q8BG18 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Necab1Q8BG18 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Necab1Q8BG18 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Necab1Q8BG18 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Necab1Q8BG18 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Necab1Q8BG18 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms