Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG15

Ctdspl2, CTD small phosphatase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdspl2Q8BG15 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ctdspl2Q8BG15 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ctdspl2Q8BG15 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ctdspl2Q8BG15 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ctdspl2Q8BG15 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ctdspl2Q8BG15 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ctdspl2Q8BG15 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ctdspl2Q8BG15 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ctdspl2Q8BG15 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ctdspl2Q8BG15 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ctdspl2Q8BG15 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ctdspl2Q8BG15 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ctdspl2Q8BG15 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ctdspl2Q8BG15 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ctdspl2Q8BG15 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ctdspl2Q8BG15 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ctdspl2Q8BG15 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ctdspl2Q8BG15 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ctdspl2Q8BG15 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ctdspl2Q8BG15 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ctdspl2Q8BG15 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ctdspl2Q8BG15 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ctdspl2Q8BG15 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ctdspl2Q8BG15 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ctdspl2Q8BG15 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ctdspl2Q8BG15 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ctdspl2Q8BG15 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ctdspl2Q8BG15 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ctdspl2Q8BG15 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ctdspl2Q8BG15 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ctdspl2Q8BG15 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ctdspl2Q8BG15 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ctdspl2Q8BG15 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ctdspl2Q8BG15 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ctdspl2Q8BG15 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ctdspl2Q8BG15 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ctdspl2Q8BG15 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ctdspl2Q8BG15 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ctdspl2Q8BG15 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ctdspl2Q8BG15 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ctdspl2Q8BG15 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ctdspl2Q8BG15 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ctdspl2Q8BG15 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ctdspl2Q8BG15 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ctdspl2Q8BG15 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ctdspl2Q8BG15 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ctdspl2Q8BG15 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ctdspl2Q8BG15 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ctdspl2Q8BG15 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ctdspl2Q8BG15 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ctdspl2Q8BG15 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ctdspl2Q8BG15 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ctdspl2Q8BG15 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ctdspl2Q8BG15 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ctdspl2Q8BG15 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ctdspl2Q8BG15 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ctdspl2Q8BG15 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ctdspl2Q8BG15 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ctdspl2Q8BG15 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ctdspl2Q8BG15 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ctdspl2Q8BG15 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ctdspl2Q8BG15 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ctdspl2Q8BG15 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ctdspl2Q8BG15 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ctdspl2Q8BG15 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ctdspl2Q8BG15 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ctdspl2Q8BG15 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ctdspl2Q8BG15 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Ctdspl2Q8BG15 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ctdspl2Q8BG15 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ctdspl2Q8BG15 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ctdspl2Q8BG15 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ctdspl2Q8BG15 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ctdspl2Q8BG15 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ctdspl2Q8BG15 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ctdspl2Q8BG15 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ctdspl2Q8BG15 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ctdspl2Q8BG15 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ctdspl2Q8BG15 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ctdspl2Q8BG15 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ctdspl2Q8BG15 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ctdspl2Q8BG15 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ctdspl2Q8BG15 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ctdspl2Q8BG15 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ctdspl2Q8BG15 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ctdspl2Q8BG15 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ctdspl2Q8BG15 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ctdspl2Q8BG15 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ctdspl2Q8BG15 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ctdspl2Q8BG15 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ctdspl2Q8BG15 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ctdspl2Q8BG15 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ctdspl2Q8BG15 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ctdspl2Q8BG15 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ctdspl2Q8BG15 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ctdspl2Q8BG15 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ctdspl2Q8BG15 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ctdspl2Q8BG15 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ctdspl2Q8BG15 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ctdspl2Q8BG15 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 218 ms