Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS5

Lrrc27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc27Q80YS5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrc27Q80YS5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrc27Q80YS5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrc27Q80YS5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Lrrc27Q80YS5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrc27Q80YS5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrc27Q80YS5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrc27Q80YS5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrc27Q80YS5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrc27Q80YS5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrc27Q80YS5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrc27Q80YS5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc27Q80YS5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc27Q80YS5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc27Q80YS5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc27Q80YS5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrc27Q80YS5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrc27Q80YS5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrc27Q80YS5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc27Q80YS5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc27Q80YS5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lrrc27Q80YS5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrrc27Q80YS5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrrc27Q80YS5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc27Q80YS5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc27Q80YS5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrc27Q80YS5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrc27Q80YS5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrc27Q80YS5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrc27Q80YS5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrc27Q80YS5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrc27Q80YS5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrc27Q80YS5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrc27Q80YS5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrc27Q80YS5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrc27Q80YS5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrc27Q80YS5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrc27Q80YS5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrc27Q80YS5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrrc27Q80YS5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc27Q80YS5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc27Q80YS5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc27Q80YS5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc27Q80YS5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc27Q80YS5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc27Q80YS5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc27Q80YS5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc27Q80YS5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc27Q80YS5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc27Q80YS5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc27Q80YS5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc27Q80YS5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc27Q80YS5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc27Q80YS5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc27Q80YS5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc27Q80YS5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc27Q80YS5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrc27Q80YS5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc27Q80YS5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc27Q80YS5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrc27Q80YS5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrc27Q80YS5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrc27Q80YS5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc27Q80YS5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc27Q80YS5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrc27Q80YS5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc27Q80YS5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc27Q80YS5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc27Q80YS5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrc27Q80YS5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc27Q80YS5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc27Q80YS5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc27Q80YS5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrc27Q80YS5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc27Q80YS5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc27Q80YS5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrc27Q80YS5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc27Q80YS5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc27Q80YS5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc27Q80YS5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc27Q80YS5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc27Q80YS5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc27Q80YS5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc27Q80YS5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc27Q80YS5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrc27Q80YS5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc27Q80YS5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc27Q80YS5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc27Q80YS5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc27Q80YS5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc27Q80YS5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc27Q80YS5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc27Q80YS5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrc27Q80YS5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc27Q80YS5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc27Q80YS5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc27Q80YS5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc27Q80YS5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc27Q80YS5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc27Q80YS5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms