Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Kdm5bQ80Y84 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
Kdm5bQ80Y84 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Kdm5bQ80Y84 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Kdm5bQ80Y84 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
Kdm5bQ80Y84 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Kdm5bQ80Y84 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Kdm5bQ80Y84 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Kdm5bQ80Y84 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Kdm5bQ80Y84 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Kdm5bQ80Y84 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Kdm5bQ80Y84 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Kdm5bQ80Y84 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Kdm5bQ80Y84 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Kdm5bQ80Y84 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Kdm5bQ80Y84 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Kdm5bQ80Y84 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Kdm5bQ80Y84 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Kdm5bQ80Y84 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Kdm5bQ80Y84 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Kdm5bQ80Y84 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Kdm5bQ80Y84 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
Kdm5bQ80Y84 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Kdm5bQ80Y84 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Kdm5bQ80Y84 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Kdm5bQ80Y84 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Kdm5bQ80Y84 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Kdm5bQ80Y84 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Kdm5bQ80Y84 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Kdm5bQ80Y84 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Kdm5bQ80Y84 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Kdm5bQ80Y84 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Kdm5bQ80Y84 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
Kdm5bQ80Y84 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Kdm5bQ80Y84 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Kdm5bQ80Y84 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Kdm5bQ80Y84 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Kdm5bQ80Y84 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
Kdm5bQ80Y84 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
Kdm5bQ80Y84 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Kdm5bQ80Y84 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Kdm5bQ80Y84 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Kdm5bQ80Y84 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Kdm5bQ80Y84 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Kdm5bQ80Y84 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Kdm5bQ80Y84 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
Kdm5bQ80Y84 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Kdm5bQ80Y84 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Kdm5bQ80Y84 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Kdm5bQ80Y84 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Kdm5bQ80Y84 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
Kdm5bQ80Y84 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Kdm5bQ80Y84 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Kdm5bQ80Y84 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Kdm5bQ80Y84 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Kdm5bQ80Y84 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Kdm5bQ80Y84 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Kdm5bQ80Y84 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
Kdm5bQ80Y84 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Kdm5bQ80Y84 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Kdm5bQ80Y84 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Kdm5bQ80Y84 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Kdm5bQ80Y84 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
Kdm5bQ80Y84 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
Kdm5bQ80Y84 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Kdm5bQ80Y84 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Kdm5bQ80Y84 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Kdm5bQ80Y84 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Kdm5bQ80Y84 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Kdm5bQ80Y84 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Kdm5bQ80Y84 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Kdm5bQ80Y84 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Kdm5bQ80Y84 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Kdm5bQ80Y84 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Kdm5bQ80Y84 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Kdm5bQ80Y84 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Kdm5bQ80Y84 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Kdm5bQ80Y84 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Kdm5bQ80Y84 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
Kdm5bQ80Y84 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Kdm5bQ80Y84 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Kdm5bQ80Y84 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Kdm5bQ80Y84 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Kdm5bQ80Y84 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Kdm5bQ80Y84 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Kdm5bQ80Y84 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Kdm5bQ80Y84 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Kdm5bQ80Y84 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.42
Kdm5bQ80Y84 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Kdm5bQ80Y84 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Kdm5bQ80Y84 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Kdm5bQ80Y84 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Kdm5bQ80Y84 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Kdm5bQ80Y84 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Kdm5bQ80Y84 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Kdm5bQ80Y84 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Kdm5bQ80Y84 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Kdm5bQ80Y84 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Kdm5bQ80Y84 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Kdm5bQ80Y84 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms