Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg2bQ80XK6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg2bQ80XK6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Atg2bQ80XK6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg2bQ80XK6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Atg2bQ80XK6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Atg2bQ80XK6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg2bQ80XK6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg2bQ80XK6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg2bQ80XK6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg2bQ80XK6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg2bQ80XK6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg2bQ80XK6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg2bQ80XK6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg2bQ80XK6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg2bQ80XK6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg2bQ80XK6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg2bQ80XK6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg2bQ80XK6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg2bQ80XK6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg2bQ80XK6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg2bQ80XK6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg2bQ80XK6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg2bQ80XK6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg2bQ80XK6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg2bQ80XK6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg2bQ80XK6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg2bQ80XK6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg2bQ80XK6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg2bQ80XK6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg2bQ80XK6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg2bQ80XK6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg2bQ80XK6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg2bQ80XK6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg2bQ80XK6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg2bQ80XK6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg2bQ80XK6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg2bQ80XK6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg2bQ80XK6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg2bQ80XK6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg2bQ80XK6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg2bQ80XK6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg2bQ80XK6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg2bQ80XK6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg2bQ80XK6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg2bQ80XK6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg2bQ80XK6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg2bQ80XK6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg2bQ80XK6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg2bQ80XK6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg2bQ80XK6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg2bQ80XK6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg2bQ80XK6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg2bQ80XK6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg2bQ80XK6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg2bQ80XK6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg2bQ80XK6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg2bQ80XK6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg2bQ80XK6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg2bQ80XK6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg2bQ80XK6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg2bQ80XK6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg2bQ80XK6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg2bQ80XK6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg2bQ80XK6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg2bQ80XK6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg2bQ80XK6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg2bQ80XK6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg2bQ80XK6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg2bQ80XK6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Atg2bQ80XK6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atg2bQ80XK6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atg2bQ80XK6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atg2bQ80XK6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atg2bQ80XK6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg2bQ80XK6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg2bQ80XK6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg2bQ80XK6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg2bQ80XK6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg2bQ80XK6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg2bQ80XK6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg2bQ80XK6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg2bQ80XK6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg2bQ80XK6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg2bQ80XK6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg2bQ80XK6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg2bQ80XK6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg2bQ80XK6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg2bQ80XK6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg2bQ80XK6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg2bQ80XK6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg2bQ80XK6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg2bQ80XK6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg2bQ80XK6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg2bQ80XK6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg2bQ80XK6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg2bQ80XK6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg2bQ80XK6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Atg2bQ80XK6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg2bQ80XK6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms