Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW5

Whrn, Whirlin, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhrnQ80VW5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
WhrnQ80VW5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
WhrnQ80VW5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
WhrnQ80VW5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
WhrnQ80VW5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
WhrnQ80VW5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
WhrnQ80VW5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
WhrnQ80VW5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
WhrnQ80VW5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
WhrnQ80VW5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
WhrnQ80VW5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
WhrnQ80VW5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
WhrnQ80VW5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
WhrnQ80VW5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
WhrnQ80VW5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
WhrnQ80VW5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
WhrnQ80VW5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
WhrnQ80VW5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
WhrnQ80VW5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
WhrnQ80VW5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
WhrnQ80VW5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
WhrnQ80VW5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
WhrnQ80VW5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
WhrnQ80VW5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
WhrnQ80VW5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
WhrnQ80VW5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
WhrnQ80VW5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
WhrnQ80VW5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
WhrnQ80VW5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
WhrnQ80VW5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
WhrnQ80VW5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
WhrnQ80VW5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
WhrnQ80VW5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
WhrnQ80VW5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
WhrnQ80VW5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
WhrnQ80VW5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
WhrnQ80VW5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
WhrnQ80VW5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
WhrnQ80VW5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
WhrnQ80VW5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
WhrnQ80VW5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
WhrnQ80VW5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
WhrnQ80VW5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
WhrnQ80VW5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
WhrnQ80VW5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
WhrnQ80VW5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
WhrnQ80VW5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
WhrnQ80VW5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
WhrnQ80VW5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
WhrnQ80VW5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
WhrnQ80VW5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
WhrnQ80VW5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
WhrnQ80VW5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
WhrnQ80VW5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
WhrnQ80VW5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
WhrnQ80VW5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
WhrnQ80VW5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
WhrnQ80VW5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
WhrnQ80VW5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
WhrnQ80VW5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
WhrnQ80VW5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
WhrnQ80VW5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
WhrnQ80VW5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
WhrnQ80VW5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
WhrnQ80VW5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
WhrnQ80VW5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
WhrnQ80VW5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
WhrnQ80VW5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
WhrnQ80VW5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
WhrnQ80VW5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
WhrnQ80VW5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
WhrnQ80VW5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
WhrnQ80VW5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
WhrnQ80VW5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
WhrnQ80VW5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
WhrnQ80VW5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
WhrnQ80VW5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
WhrnQ80VW5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
WhrnQ80VW5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
WhrnQ80VW5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
WhrnQ80VW5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
WhrnQ80VW5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
WhrnQ80VW5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
WhrnQ80VW5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WhrnQ80VW5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WhrnQ80VW5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WhrnQ80VW5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WhrnQ80VW5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WhrnQ80VW5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WhrnQ80VW5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
WhrnQ80VW5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
WhrnQ80VW5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
WhrnQ80VW5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
WhrnQ80VW5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
WhrnQ80VW5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
WhrnQ80VW5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
WhrnQ80VW5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
WhrnQ80VW5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
WhrnQ80VW5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
WhrnQ80VW5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms