Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sestd1Q80UK0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sestd1Q80UK0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sestd1Q80UK0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sestd1Q80UK0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sestd1Q80UK0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sestd1Q80UK0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sestd1Q80UK0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Sestd1Q80UK0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sestd1Q80UK0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sestd1Q80UK0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sestd1Q80UK0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Sestd1Q80UK0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sestd1Q80UK0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Sestd1Q80UK0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Sestd1Q80UK0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sestd1Q80UK0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Sestd1Q80UK0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sestd1Q80UK0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sestd1Q80UK0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sestd1Q80UK0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sestd1Q80UK0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sestd1Q80UK0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Sestd1Q80UK0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sestd1Q80UK0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sestd1Q80UK0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sestd1Q80UK0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sestd1Q80UK0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sestd1Q80UK0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sestd1Q80UK0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sestd1Q80UK0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sestd1Q80UK0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sestd1Q80UK0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sestd1Q80UK0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Sestd1Q80UK0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sestd1Q80UK0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sestd1Q80UK0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Sestd1Q80UK0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Sestd1Q80UK0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Sestd1Q80UK0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sestd1Q80UK0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sestd1Q80UK0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sestd1Q80UK0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sestd1Q80UK0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sestd1Q80UK0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sestd1Q80UK0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sestd1Q80UK0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sestd1Q80UK0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sestd1Q80UK0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sestd1Q80UK0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sestd1Q80UK0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sestd1Q80UK0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sestd1Q80UK0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Sestd1Q80UK0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sestd1Q80UK0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sestd1Q80UK0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sestd1Q80UK0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sestd1Q80UK0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sestd1Q80UK0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sestd1Q80UK0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sestd1Q80UK0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sestd1Q80UK0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sestd1Q80UK0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sestd1Q80UK0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Sestd1Q80UK0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sestd1Q80UK0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sestd1Q80UK0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Sestd1Q80UK0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sestd1Q80UK0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Sestd1Q80UK0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sestd1Q80UK0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sestd1Q80UK0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sestd1Q80UK0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sestd1Q80UK0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sestd1Q80UK0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sestd1Q80UK0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sestd1Q80UK0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Sestd1Q80UK0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sestd1Q80UK0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sestd1Q80UK0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sestd1Q80UK0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sestd1Q80UK0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sestd1Q80UK0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sestd1Q80UK0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Sestd1Q80UK0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Sestd1Q80UK0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sestd1Q80UK0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sestd1Q80UK0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sestd1Q80UK0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sestd1Q80UK0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sestd1Q80UK0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sestd1Q80UK0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sestd1Q80UK0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sestd1Q80UK0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sestd1Q80UK0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Sestd1Q80UK0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sestd1Q80UK0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sestd1Q80UK0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sestd1Q80UK0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sestd1Q80UK0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms