Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ube3cQ80U95 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Ube3cQ80U95 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Ube3cQ80U95 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ube3cQ80U95 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ube3cQ80U95 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ube3cQ80U95 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ube3cQ80U95 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Ube3cQ80U95 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Ube3cQ80U95 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ube3cQ80U95 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ube3cQ80U95 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ube3cQ80U95 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ube3cQ80U95 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ube3cQ80U95 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ube3cQ80U95 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ube3cQ80U95 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ube3cQ80U95 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ube3cQ80U95 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ube3cQ80U95 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Ube3cQ80U95 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ube3cQ80U95 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ube3cQ80U95 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ube3cQ80U95 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ube3cQ80U95 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ube3cQ80U95 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ube3cQ80U95 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ube3cQ80U95 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Ube3cQ80U95 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ube3cQ80U95 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ube3cQ80U95 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ube3cQ80U95 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ube3cQ80U95 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ube3cQ80U95 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ube3cQ80U95 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ube3cQ80U95 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Ube3cQ80U95 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ube3cQ80U95 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ube3cQ80U95 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ube3cQ80U95 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Ube3cQ80U95 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ube3cQ80U95 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ube3cQ80U95 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ube3cQ80U95 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ube3cQ80U95 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ube3cQ80U95 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ube3cQ80U95 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ube3cQ80U95 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Ube3cQ80U95 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ube3cQ80U95 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ube3cQ80U95 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ube3cQ80U95 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ube3cQ80U95 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ube3cQ80U95 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Ube3cQ80U95 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ube3cQ80U95 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ube3cQ80U95 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ube3cQ80U95 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Ube3cQ80U95 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ube3cQ80U95 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ube3cQ80U95 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ube3cQ80U95 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ube3cQ80U95 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ube3cQ80U95 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ube3cQ80U95 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ube3cQ80U95 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ube3cQ80U95 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ube3cQ80U95 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ube3cQ80U95 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Ube3cQ80U95 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ube3cQ80U95 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ube3cQ80U95 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ube3cQ80U95 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ube3cQ80U95 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ube3cQ80U95 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ube3cQ80U95 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ube3cQ80U95 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Ube3cQ80U95 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ube3cQ80U95 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ube3cQ80U95 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ube3cQ80U95 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ube3cQ80U95 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ube3cQ80U95 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ube3cQ80U95 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ube3cQ80U95 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ube3cQ80U95 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ube3cQ80U95 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ube3cQ80U95 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ube3cQ80U95 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ube3cQ80U95 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ube3cQ80U95 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ube3cQ80U95 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ube3cQ80U95 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ube3cQ80U95 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ube3cQ80U95 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ube3cQ80U95 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ube3cQ80U95 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ube3cQ80U95 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ube3cQ80U95 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ube3cQ80U95 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms