Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSI0

Znf12, Zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf12Q7TSI0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Znf12Q7TSI0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Znf12Q7TSI0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Znf12Q7TSI0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Znf12Q7TSI0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Znf12Q7TSI0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Znf12Q7TSI0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Znf12Q7TSI0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Znf12Q7TSI0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Znf12Q7TSI0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Znf12Q7TSI0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Znf12Q7TSI0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Znf12Q7TSI0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Znf12Q7TSI0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Znf12Q7TSI0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Znf12Q7TSI0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Znf12Q7TSI0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Znf12Q7TSI0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Znf12Q7TSI0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Znf12Q7TSI0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Znf12Q7TSI0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Znf12Q7TSI0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Znf12Q7TSI0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Znf12Q7TSI0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Znf12Q7TSI0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Znf12Q7TSI0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Znf12Q7TSI0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Znf12Q7TSI0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Znf12Q7TSI0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Znf12Q7TSI0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Znf12Q7TSI0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Znf12Q7TSI0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Znf12Q7TSI0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Znf12Q7TSI0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Znf12Q7TSI0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Znf12Q7TSI0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Znf12Q7TSI0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Znf12Q7TSI0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Znf12Q7TSI0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Znf12Q7TSI0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Znf12Q7TSI0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Znf12Q7TSI0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Znf12Q7TSI0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Znf12Q7TSI0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Znf12Q7TSI0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Znf12Q7TSI0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Znf12Q7TSI0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Znf12Q7TSI0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Znf12Q7TSI0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Znf12Q7TSI0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Znf12Q7TSI0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Znf12Q7TSI0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Znf12Q7TSI0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Znf12Q7TSI0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Znf12Q7TSI0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Znf12Q7TSI0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Znf12Q7TSI0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Znf12Q7TSI0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Znf12Q7TSI0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Znf12Q7TSI0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Znf12Q7TSI0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Znf12Q7TSI0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Znf12Q7TSI0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Znf12Q7TSI0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Znf12Q7TSI0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Znf12Q7TSI0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Znf12Q7TSI0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Znf12Q7TSI0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Znf12Q7TSI0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf12Q7TSI0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf12Q7TSI0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf12Q7TSI0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf12Q7TSI0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf12Q7TSI0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf12Q7TSI0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Znf12Q7TSI0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Znf12Q7TSI0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Znf12Q7TSI0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Znf12Q7TSI0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Znf12Q7TSI0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf12Q7TSI0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf12Q7TSI0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf12Q7TSI0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf12Q7TSI0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Znf12Q7TSI0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf12Q7TSI0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf12Q7TSI0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf12Q7TSI0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf12Q7TSI0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf12Q7TSI0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf12Q7TSI0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf12Q7TSI0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf12Q7TSI0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf12Q7TSI0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf12Q7TSI0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf12Q7TSI0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf12Q7TSI0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf12Q7TSI0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf12Q7TSI0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf12Q7TSI0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms