Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN37

Trpm4, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm4Q7TN37 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpm4Q7TN37 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpm4Q7TN37 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpm4Q7TN37 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpm4Q7TN37 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpm4Q7TN37 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpm4Q7TN37 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpm4Q7TN37 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpm4Q7TN37 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpm4Q7TN37 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpm4Q7TN37 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpm4Q7TN37 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpm4Q7TN37 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpm4Q7TN37 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpm4Q7TN37 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpm4Q7TN37 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpm4Q7TN37 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpm4Q7TN37 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpm4Q7TN37 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trpm4Q7TN37 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpm4Q7TN37 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpm4Q7TN37 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpm4Q7TN37 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpm4Q7TN37 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpm4Q7TN37 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpm4Q7TN37 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpm4Q7TN37 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpm4Q7TN37 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpm4Q7TN37 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpm4Q7TN37 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpm4Q7TN37 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpm4Q7TN37 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpm4Q7TN37 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpm4Q7TN37 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpm4Q7TN37 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpm4Q7TN37 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpm4Q7TN37 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpm4Q7TN37 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpm4Q7TN37 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpm4Q7TN37 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpm4Q7TN37 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpm4Q7TN37 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpm4Q7TN37 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpm4Q7TN37 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpm4Q7TN37 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpm4Q7TN37 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpm4Q7TN37 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpm4Q7TN37 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpm4Q7TN37 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpm4Q7TN37 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpm4Q7TN37 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpm4Q7TN37 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpm4Q7TN37 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpm4Q7TN37 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpm4Q7TN37 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpm4Q7TN37 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpm4Q7TN37 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpm4Q7TN37 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpm4Q7TN37 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpm4Q7TN37 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpm4Q7TN37 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpm4Q7TN37 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpm4Q7TN37 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpm4Q7TN37 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpm4Q7TN37 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trpm4Q7TN37 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trpm4Q7TN37 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpm4Q7TN37 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpm4Q7TN37 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpm4Q7TN37 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpm4Q7TN37 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpm4Q7TN37 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpm4Q7TN37 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpm4Q7TN37 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpm4Q7TN37 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpm4Q7TN37 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpm4Q7TN37 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpm4Q7TN37 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpm4Q7TN37 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpm4Q7TN37 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpm4Q7TN37 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpm4Q7TN37 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpm4Q7TN37 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpm4Q7TN37 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpm4Q7TN37 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpm4Q7TN37 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpm4Q7TN37 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpm4Q7TN37 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpm4Q7TN37 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpm4Q7TN37 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpm4Q7TN37 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpm4Q7TN37 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpm4Q7TN37 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trpm4Q7TN37 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trpm4Q7TN37 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trpm4Q7TN37 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trpm4Q7TN37 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpm4Q7TN37 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpm4Q7TN37 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpm4Q7TN37 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms