Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snd1Q78PY7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snd1Q78PY7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snd1Q78PY7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snd1Q78PY7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snd1Q78PY7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snd1Q78PY7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snd1Q78PY7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snd1Q78PY7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snd1Q78PY7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snd1Q78PY7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snd1Q78PY7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snd1Q78PY7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snd1Q78PY7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snd1Q78PY7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snd1Q78PY7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snd1Q78PY7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snd1Q78PY7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snd1Q78PY7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Snd1Q78PY7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snd1Q78PY7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snd1Q78PY7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snd1Q78PY7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snd1Q78PY7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snd1Q78PY7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snd1Q78PY7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snd1Q78PY7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snd1Q78PY7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snd1Q78PY7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snd1Q78PY7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snd1Q78PY7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snd1Q78PY7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snd1Q78PY7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snd1Q78PY7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snd1Q78PY7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Snd1Q78PY7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snd1Q78PY7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snd1Q78PY7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snd1Q78PY7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snd1Q78PY7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snd1Q78PY7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snd1Q78PY7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snd1Q78PY7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snd1Q78PY7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snd1Q78PY7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snd1Q78PY7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snd1Q78PY7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snd1Q78PY7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snd1Q78PY7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snd1Q78PY7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snd1Q78PY7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snd1Q78PY7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snd1Q78PY7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snd1Q78PY7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snd1Q78PY7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snd1Q78PY7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snd1Q78PY7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snd1Q78PY7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Snd1Q78PY7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snd1Q78PY7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snd1Q78PY7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snd1Q78PY7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snd1Q78PY7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Snd1Q78PY7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snd1Q78PY7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snd1Q78PY7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snd1Q78PY7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snd1Q78PY7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snd1Q78PY7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snd1Q78PY7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snd1Q78PY7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snd1Q78PY7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snd1Q78PY7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snd1Q78PY7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snd1Q78PY7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snd1Q78PY7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snd1Q78PY7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Snd1Q78PY7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snd1Q78PY7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snd1Q78PY7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snd1Q78PY7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snd1Q78PY7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snd1Q78PY7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snd1Q78PY7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Snd1Q78PY7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Snd1Q78PY7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snd1Q78PY7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snd1Q78PY7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snd1Q78PY7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snd1Q78PY7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snd1Q78PY7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snd1Q78PY7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Snd1Q78PY7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snd1Q78PY7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snd1Q78PY7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snd1Q78PY7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snd1Q78PY7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snd1Q78PY7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snd1Q78PY7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snd1Q78PY7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms