Protein–RNA interactions for Protein: Q76I79

Ssh1, Protein phosphatase Slingshot homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh1Q76I79 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ssh1Q76I79 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ssh1Q76I79 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ssh1Q76I79 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ssh1Q76I79 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ssh1Q76I79 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Ssh1Q76I79 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ssh1Q76I79 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ssh1Q76I79 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ssh1Q76I79 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ssh1Q76I79 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ssh1Q76I79 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ssh1Q76I79 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ssh1Q76I79 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ssh1Q76I79 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Ssh1Q76I79 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ssh1Q76I79 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ssh1Q76I79 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ssh1Q76I79 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ssh1Q76I79 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ssh1Q76I79 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ssh1Q76I79 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ssh1Q76I79 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ssh1Q76I79 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ssh1Q76I79 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ssh1Q76I79 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ssh1Q76I79 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ssh1Q76I79 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ssh1Q76I79 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ssh1Q76I79 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ssh1Q76I79 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ssh1Q76I79 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ssh1Q76I79 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ssh1Q76I79 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Ssh1Q76I79 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ssh1Q76I79 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ssh1Q76I79 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ssh1Q76I79 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ssh1Q76I79 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ssh1Q76I79 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ssh1Q76I79 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ssh1Q76I79 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ssh1Q76I79 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ssh1Q76I79 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ssh1Q76I79 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ssh1Q76I79 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ssh1Q76I79 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ssh1Q76I79 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ssh1Q76I79 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ssh1Q76I79 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ssh1Q76I79 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ssh1Q76I79 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ssh1Q76I79 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ssh1Q76I79 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ssh1Q76I79 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Ssh1Q76I79 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ssh1Q76I79 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ssh1Q76I79 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ssh1Q76I79 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ssh1Q76I79 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ssh1Q76I79 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ssh1Q76I79 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ssh1Q76I79 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ssh1Q76I79 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ssh1Q76I79 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ssh1Q76I79 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ssh1Q76I79 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ssh1Q76I79 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ssh1Q76I79 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ssh1Q76I79 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ssh1Q76I79 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ssh1Q76I79 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ssh1Q76I79 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ssh1Q76I79 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ssh1Q76I79 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ssh1Q76I79 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ssh1Q76I79 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ssh1Q76I79 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ssh1Q76I79 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ssh1Q76I79 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ssh1Q76I79 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ssh1Q76I79 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ssh1Q76I79 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ssh1Q76I79 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ssh1Q76I79 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ssh1Q76I79 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ssh1Q76I79 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ssh1Q76I79 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ssh1Q76I79 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ssh1Q76I79 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ssh1Q76I79 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ssh1Q76I79 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ssh1Q76I79 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ssh1Q76I79 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ssh1Q76I79 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ssh1Q76I79 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ssh1Q76I79 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ssh1Q76I79 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ssh1Q76I79 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ssh1Q76I79 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms