Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ7

Spcs3, Signal peptidase complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spcs3Q6ZWQ7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spcs3Q6ZWQ7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spcs3Q6ZWQ7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Spcs3Q6ZWQ7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spcs3Q6ZWQ7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spcs3Q6ZWQ7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spcs3Q6ZWQ7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spcs3Q6ZWQ7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spcs3Q6ZWQ7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spcs3Q6ZWQ7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spcs3Q6ZWQ7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spcs3Q6ZWQ7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spcs3Q6ZWQ7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spcs3Q6ZWQ7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spcs3Q6ZWQ7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spcs3Q6ZWQ7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spcs3Q6ZWQ7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Spcs3Q6ZWQ7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spcs3Q6ZWQ7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spcs3Q6ZWQ7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spcs3Q6ZWQ7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spcs3Q6ZWQ7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spcs3Q6ZWQ7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spcs3Q6ZWQ7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spcs3Q6ZWQ7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spcs3Q6ZWQ7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spcs3Q6ZWQ7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spcs3Q6ZWQ7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spcs3Q6ZWQ7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spcs3Q6ZWQ7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spcs3Q6ZWQ7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spcs3Q6ZWQ7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spcs3Q6ZWQ7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spcs3Q6ZWQ7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spcs3Q6ZWQ7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Spcs3Q6ZWQ7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Spcs3Q6ZWQ7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Spcs3Q6ZWQ7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Spcs3Q6ZWQ7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Spcs3Q6ZWQ7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Spcs3Q6ZWQ7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Spcs3Q6ZWQ7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Spcs3Q6ZWQ7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Spcs3Q6ZWQ7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Spcs3Q6ZWQ7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Spcs3Q6ZWQ7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Spcs3Q6ZWQ7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Spcs3Q6ZWQ7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Spcs3Q6ZWQ7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Spcs3Q6ZWQ7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Spcs3Q6ZWQ7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Spcs3Q6ZWQ7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Spcs3Q6ZWQ7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Spcs3Q6ZWQ7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Spcs3Q6ZWQ7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Spcs3Q6ZWQ7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Spcs3Q6ZWQ7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Spcs3Q6ZWQ7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Spcs3Q6ZWQ7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Spcs3Q6ZWQ7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Spcs3Q6ZWQ7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Spcs3Q6ZWQ7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spcs3Q6ZWQ7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spcs3Q6ZWQ7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spcs3Q6ZWQ7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spcs3Q6ZWQ7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spcs3Q6ZWQ7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spcs3Q6ZWQ7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spcs3Q6ZWQ7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spcs3Q6ZWQ7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spcs3Q6ZWQ7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spcs3Q6ZWQ7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spcs3Q6ZWQ7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spcs3Q6ZWQ7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spcs3Q6ZWQ7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spcs3Q6ZWQ7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spcs3Q6ZWQ7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Spcs3Q6ZWQ7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spcs3Q6ZWQ7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spcs3Q6ZWQ7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spcs3Q6ZWQ7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spcs3Q6ZWQ7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spcs3Q6ZWQ7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spcs3Q6ZWQ7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spcs3Q6ZWQ7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spcs3Q6ZWQ7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spcs3Q6ZWQ7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spcs3Q6ZWQ7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spcs3Q6ZWQ7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spcs3Q6ZWQ7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Spcs3Q6ZWQ7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Spcs3Q6ZWQ7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spcs3Q6ZWQ7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Spcs3Q6ZWQ7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spcs3Q6ZWQ7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Spcs3Q6ZWQ7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spcs3Q6ZWQ7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spcs3Q6ZWQ7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spcs3Q6ZWQ7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spcs3Q6ZWQ7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms