Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp8b3Q6UQ17 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp8b3Q6UQ17 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atp8b3Q6UQ17 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp8b3Q6UQ17 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp8b3Q6UQ17 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atp8b3Q6UQ17 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atp8b3Q6UQ17 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atp8b3Q6UQ17 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atp8b3Q6UQ17 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atp8b3Q6UQ17 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atp8b3Q6UQ17 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atp8b3Q6UQ17 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atp8b3Q6UQ17 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atp8b3Q6UQ17 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atp8b3Q6UQ17 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atp8b3Q6UQ17 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Atp8b3Q6UQ17 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Atp8b3Q6UQ17 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Atp8b3Q6UQ17 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atp8b3Q6UQ17 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atp8b3Q6UQ17 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atp8b3Q6UQ17 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Atp8b3Q6UQ17 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atp8b3Q6UQ17 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Atp8b3Q6UQ17 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atp8b3Q6UQ17 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Atp8b3Q6UQ17 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atp8b3Q6UQ17 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Atp8b3Q6UQ17 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atp8b3Q6UQ17 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atp8b3Q6UQ17 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atp8b3Q6UQ17 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atp8b3Q6UQ17 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atp8b3Q6UQ17 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atp8b3Q6UQ17 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atp8b3Q6UQ17 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atp8b3Q6UQ17 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Atp8b3Q6UQ17 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atp8b3Q6UQ17 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atp8b3Q6UQ17 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atp8b3Q6UQ17 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atp8b3Q6UQ17 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Atp8b3Q6UQ17 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Atp8b3Q6UQ17 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atp8b3Q6UQ17 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atp8b3Q6UQ17 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atp8b3Q6UQ17 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atp8b3Q6UQ17 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atp8b3Q6UQ17 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atp8b3Q6UQ17 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Atp8b3Q6UQ17 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Atp8b3Q6UQ17 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Atp8b3Q6UQ17 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atp8b3Q6UQ17 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Atp8b3Q6UQ17 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Atp8b3Q6UQ17 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atp8b3Q6UQ17 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atp8b3Q6UQ17 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atp8b3Q6UQ17 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atp8b3Q6UQ17 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atp8b3Q6UQ17 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atp8b3Q6UQ17 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atp8b3Q6UQ17 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atp8b3Q6UQ17 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atp8b3Q6UQ17 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atp8b3Q6UQ17 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atp8b3Q6UQ17 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atp8b3Q6UQ17 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atp8b3Q6UQ17 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atp8b3Q6UQ17 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp8b3Q6UQ17 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp8b3Q6UQ17 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp8b3Q6UQ17 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atp8b3Q6UQ17 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp8b3Q6UQ17 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp8b3Q6UQ17 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp8b3Q6UQ17 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp8b3Q6UQ17 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp8b3Q6UQ17 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp8b3Q6UQ17 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp8b3Q6UQ17 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp8b3Q6UQ17 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp8b3Q6UQ17 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp8b3Q6UQ17 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atp8b3Q6UQ17 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atp8b3Q6UQ17 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atp8b3Q6UQ17 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atp8b3Q6UQ17 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atp8b3Q6UQ17 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atp8b3Q6UQ17 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atp8b3Q6UQ17 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atp8b3Q6UQ17 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atp8b3Q6UQ17 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atp8b3Q6UQ17 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atp8b3Q6UQ17 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atp8b3Q6UQ17 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Atp8b3Q6UQ17 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atp8b3Q6UQ17 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
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