Protein–RNA interactions for Protein: Q6PZD9

Cebpe, CCAAT/enhancer-binding protein epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpeQ6PZD9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CebpeQ6PZD9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CebpeQ6PZD9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CebpeQ6PZD9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CebpeQ6PZD9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CebpeQ6PZD9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CebpeQ6PZD9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CebpeQ6PZD9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CebpeQ6PZD9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CebpeQ6PZD9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CebpeQ6PZD9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CebpeQ6PZD9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CebpeQ6PZD9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CebpeQ6PZD9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CebpeQ6PZD9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CebpeQ6PZD9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CebpeQ6PZD9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CebpeQ6PZD9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CebpeQ6PZD9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CebpeQ6PZD9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CebpeQ6PZD9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CebpeQ6PZD9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CebpeQ6PZD9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CebpeQ6PZD9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CebpeQ6PZD9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CebpeQ6PZD9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CebpeQ6PZD9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CebpeQ6PZD9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CebpeQ6PZD9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CebpeQ6PZD9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CebpeQ6PZD9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CebpeQ6PZD9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CebpeQ6PZD9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CebpeQ6PZD9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CebpeQ6PZD9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CebpeQ6PZD9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CebpeQ6PZD9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CebpeQ6PZD9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CebpeQ6PZD9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CebpeQ6PZD9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CebpeQ6PZD9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CebpeQ6PZD9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CebpeQ6PZD9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CebpeQ6PZD9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CebpeQ6PZD9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CebpeQ6PZD9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CebpeQ6PZD9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CebpeQ6PZD9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CebpeQ6PZD9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CebpeQ6PZD9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CebpeQ6PZD9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CebpeQ6PZD9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CebpeQ6PZD9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CebpeQ6PZD9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CebpeQ6PZD9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CebpeQ6PZD9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CebpeQ6PZD9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CebpeQ6PZD9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CebpeQ6PZD9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CebpeQ6PZD9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CebpeQ6PZD9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CebpeQ6PZD9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CebpeQ6PZD9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CebpeQ6PZD9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CebpeQ6PZD9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CebpeQ6PZD9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CebpeQ6PZD9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CebpeQ6PZD9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CebpeQ6PZD9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CebpeQ6PZD9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CebpeQ6PZD9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CebpeQ6PZD9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CebpeQ6PZD9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CebpeQ6PZD9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CebpeQ6PZD9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CebpeQ6PZD9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CebpeQ6PZD9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CebpeQ6PZD9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CebpeQ6PZD9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CebpeQ6PZD9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CebpeQ6PZD9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CebpeQ6PZD9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CebpeQ6PZD9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CebpeQ6PZD9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CebpeQ6PZD9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CebpeQ6PZD9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CebpeQ6PZD9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CebpeQ6PZD9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CebpeQ6PZD9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CebpeQ6PZD9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CebpeQ6PZD9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CebpeQ6PZD9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CebpeQ6PZD9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CebpeQ6PZD9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CebpeQ6PZD9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CebpeQ6PZD9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CebpeQ6PZD9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CebpeQ6PZD9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CebpeQ6PZD9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CebpeQ6PZD9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.2 ms