Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHZ8

Kcnip4, Kv channel-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip4Q6PHZ8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnip4Q6PHZ8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcnip4Q6PHZ8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kcnip4Q6PHZ8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnip4Q6PHZ8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnip4Q6PHZ8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnip4Q6PHZ8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnip4Q6PHZ8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnip4Q6PHZ8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnip4Q6PHZ8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnip4Q6PHZ8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnip4Q6PHZ8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnip4Q6PHZ8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnip4Q6PHZ8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnip4Q6PHZ8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnip4Q6PHZ8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnip4Q6PHZ8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnip4Q6PHZ8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnip4Q6PHZ8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnip4Q6PHZ8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnip4Q6PHZ8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnip4Q6PHZ8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnip4Q6PHZ8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnip4Q6PHZ8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnip4Q6PHZ8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnip4Q6PHZ8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnip4Q6PHZ8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnip4Q6PHZ8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnip4Q6PHZ8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnip4Q6PHZ8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnip4Q6PHZ8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnip4Q6PHZ8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnip4Q6PHZ8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnip4Q6PHZ8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnip4Q6PHZ8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnip4Q6PHZ8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnip4Q6PHZ8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnip4Q6PHZ8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnip4Q6PHZ8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnip4Q6PHZ8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnip4Q6PHZ8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnip4Q6PHZ8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnip4Q6PHZ8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnip4Q6PHZ8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnip4Q6PHZ8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnip4Q6PHZ8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnip4Q6PHZ8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnip4Q6PHZ8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnip4Q6PHZ8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnip4Q6PHZ8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnip4Q6PHZ8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnip4Q6PHZ8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnip4Q6PHZ8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnip4Q6PHZ8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnip4Q6PHZ8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnip4Q6PHZ8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnip4Q6PHZ8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnip4Q6PHZ8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnip4Q6PHZ8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnip4Q6PHZ8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnip4Q6PHZ8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Kcnip4Q6PHZ8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcnip4Q6PHZ8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcnip4Q6PHZ8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcnip4Q6PHZ8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnip4Q6PHZ8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnip4Q6PHZ8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnip4Q6PHZ8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnip4Q6PHZ8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kcnip4Q6PHZ8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnip4Q6PHZ8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnip4Q6PHZ8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnip4Q6PHZ8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnip4Q6PHZ8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnip4Q6PHZ8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnip4Q6PHZ8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnip4Q6PHZ8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnip4Q6PHZ8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kcnip4Q6PHZ8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnip4Q6PHZ8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnip4Q6PHZ8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnip4Q6PHZ8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnip4Q6PHZ8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnip4Q6PHZ8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnip4Q6PHZ8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnip4Q6PHZ8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnip4Q6PHZ8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnip4Q6PHZ8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnip4Q6PHZ8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnip4Q6PHZ8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnip4Q6PHZ8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnip4Q6PHZ8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnip4Q6PHZ8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnip4Q6PHZ8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnip4Q6PHZ8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnip4Q6PHZ8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnip4Q6PHZ8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnip4Q6PHZ8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnip4Q6PHZ8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnip4Q6PHZ8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms