Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF93

Pik3c3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c3Q6PF93 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Pik3c3Q6PF93 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pik3c3Q6PF93 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pik3c3Q6PF93 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pik3c3Q6PF93 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pik3c3Q6PF93 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pik3c3Q6PF93 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pik3c3Q6PF93 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pik3c3Q6PF93 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pik3c3Q6PF93 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pik3c3Q6PF93 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pik3c3Q6PF93 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pik3c3Q6PF93 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pik3c3Q6PF93 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pik3c3Q6PF93 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pik3c3Q6PF93 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pik3c3Q6PF93 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pik3c3Q6PF93 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pik3c3Q6PF93 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pik3c3Q6PF93 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pik3c3Q6PF93 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pik3c3Q6PF93 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pik3c3Q6PF93 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pik3c3Q6PF93 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pik3c3Q6PF93 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pik3c3Q6PF93 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pik3c3Q6PF93 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pik3c3Q6PF93 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pik3c3Q6PF93 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pik3c3Q6PF93 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pik3c3Q6PF93 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pik3c3Q6PF93 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pik3c3Q6PF93 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pik3c3Q6PF93 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pik3c3Q6PF93 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pik3c3Q6PF93 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pik3c3Q6PF93 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pik3c3Q6PF93 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pik3c3Q6PF93 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pik3c3Q6PF93 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pik3c3Q6PF93 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pik3c3Q6PF93 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pik3c3Q6PF93 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pik3c3Q6PF93 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pik3c3Q6PF93 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pik3c3Q6PF93 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pik3c3Q6PF93 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pik3c3Q6PF93 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pik3c3Q6PF93 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pik3c3Q6PF93 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pik3c3Q6PF93 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pik3c3Q6PF93 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pik3c3Q6PF93 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pik3c3Q6PF93 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pik3c3Q6PF93 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pik3c3Q6PF93 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pik3c3Q6PF93 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pik3c3Q6PF93 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pik3c3Q6PF93 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pik3c3Q6PF93 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Pik3c3Q6PF93 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pik3c3Q6PF93 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pik3c3Q6PF93 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pik3c3Q6PF93 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pik3c3Q6PF93 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pik3c3Q6PF93 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pik3c3Q6PF93 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pik3c3Q6PF93 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pik3c3Q6PF93 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pik3c3Q6PF93 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pik3c3Q6PF93 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pik3c3Q6PF93 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pik3c3Q6PF93 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pik3c3Q6PF93 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pik3c3Q6PF93 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pik3c3Q6PF93 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pik3c3Q6PF93 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pik3c3Q6PF93 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pik3c3Q6PF93 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pik3c3Q6PF93 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pik3c3Q6PF93 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pik3c3Q6PF93 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pik3c3Q6PF93 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pik3c3Q6PF93 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pik3c3Q6PF93 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pik3c3Q6PF93 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pik3c3Q6PF93 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pik3c3Q6PF93 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pik3c3Q6PF93 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pik3c3Q6PF93 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pik3c3Q6PF93 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pik3c3Q6PF93 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pik3c3Q6PF93 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pik3c3Q6PF93 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pik3c3Q6PF93 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pik3c3Q6PF93 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pik3c3Q6PF93 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pik3c3Q6PF93 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pik3c3Q6PF93 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pik3c3Q6PF93 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms