Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CtifQ6PEE2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CtifQ6PEE2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CtifQ6PEE2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CtifQ6PEE2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CtifQ6PEE2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CtifQ6PEE2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CtifQ6PEE2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CtifQ6PEE2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CtifQ6PEE2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CtifQ6PEE2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CtifQ6PEE2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CtifQ6PEE2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CtifQ6PEE2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CtifQ6PEE2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CtifQ6PEE2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CtifQ6PEE2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CtifQ6PEE2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CtifQ6PEE2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CtifQ6PEE2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CtifQ6PEE2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CtifQ6PEE2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CtifQ6PEE2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CtifQ6PEE2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CtifQ6PEE2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CtifQ6PEE2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CtifQ6PEE2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CtifQ6PEE2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CtifQ6PEE2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CtifQ6PEE2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CtifQ6PEE2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CtifQ6PEE2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CtifQ6PEE2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CtifQ6PEE2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CtifQ6PEE2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CtifQ6PEE2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CtifQ6PEE2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CtifQ6PEE2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CtifQ6PEE2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CtifQ6PEE2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CtifQ6PEE2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CtifQ6PEE2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CtifQ6PEE2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CtifQ6PEE2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CtifQ6PEE2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CtifQ6PEE2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CtifQ6PEE2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CtifQ6PEE2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CtifQ6PEE2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CtifQ6PEE2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CtifQ6PEE2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CtifQ6PEE2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CtifQ6PEE2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CtifQ6PEE2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CtifQ6PEE2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CtifQ6PEE2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CtifQ6PEE2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CtifQ6PEE2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CtifQ6PEE2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CtifQ6PEE2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CtifQ6PEE2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CtifQ6PEE2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CtifQ6PEE2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CtifQ6PEE2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CtifQ6PEE2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CtifQ6PEE2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CtifQ6PEE2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CtifQ6PEE2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CtifQ6PEE2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CtifQ6PEE2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CtifQ6PEE2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CtifQ6PEE2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CtifQ6PEE2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CtifQ6PEE2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CtifQ6PEE2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CtifQ6PEE2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CtifQ6PEE2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CtifQ6PEE2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CtifQ6PEE2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CtifQ6PEE2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CtifQ6PEE2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CtifQ6PEE2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CtifQ6PEE2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CtifQ6PEE2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CtifQ6PEE2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CtifQ6PEE2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CtifQ6PEE2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CtifQ6PEE2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CtifQ6PEE2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CtifQ6PEE2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CtifQ6PEE2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CtifQ6PEE2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CtifQ6PEE2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CtifQ6PEE2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CtifQ6PEE2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CtifQ6PEE2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CtifQ6PEE2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CtifQ6PEE2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CtifQ6PEE2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CtifQ6PEE2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
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