Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB51

Ccdc117, Coiled-coil domain-containing protein 117, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc117Q6PB51 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc117Q6PB51 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc117Q6PB51 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc117Q6PB51 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc117Q6PB51 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc117Q6PB51 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc117Q6PB51 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc117Q6PB51 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc117Q6PB51 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc117Q6PB51 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc117Q6PB51 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc117Q6PB51 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc117Q6PB51 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc117Q6PB51 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc117Q6PB51 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc117Q6PB51 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc117Q6PB51 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc117Q6PB51 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc117Q6PB51 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc117Q6PB51 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc117Q6PB51 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc117Q6PB51 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc117Q6PB51 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc117Q6PB51 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc117Q6PB51 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc117Q6PB51 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc117Q6PB51 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc117Q6PB51 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc117Q6PB51 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc117Q6PB51 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc117Q6PB51 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc117Q6PB51 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc117Q6PB51 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc117Q6PB51 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc117Q6PB51 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc117Q6PB51 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc117Q6PB51 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc117Q6PB51 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc117Q6PB51 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc117Q6PB51 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc117Q6PB51 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc117Q6PB51 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc117Q6PB51 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc117Q6PB51 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc117Q6PB51 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc117Q6PB51 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc117Q6PB51 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc117Q6PB51 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc117Q6PB51 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc117Q6PB51 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc117Q6PB51 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc117Q6PB51 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc117Q6PB51 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc117Q6PB51 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc117Q6PB51 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc117Q6PB51 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc117Q6PB51 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc117Q6PB51 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc117Q6PB51 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc117Q6PB51 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc117Q6PB51 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc117Q6PB51 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc117Q6PB51 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc117Q6PB51 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc117Q6PB51 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc117Q6PB51 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc117Q6PB51 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc117Q6PB51 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc117Q6PB51 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc117Q6PB51 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc117Q6PB51 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc117Q6PB51 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc117Q6PB51 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc117Q6PB51 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc117Q6PB51 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc117Q6PB51 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc117Q6PB51 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc117Q6PB51 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc117Q6PB51 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc117Q6PB51 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc117Q6PB51 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc117Q6PB51 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc117Q6PB51 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc117Q6PB51 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc117Q6PB51 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc117Q6PB51 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc117Q6PB51 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc117Q6PB51 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc117Q6PB51 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc117Q6PB51 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc117Q6PB51 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc117Q6PB51 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc117Q6PB51 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc117Q6PB51 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc117Q6PB51 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc117Q6PB51 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc117Q6PB51 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc117Q6PB51 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc117Q6PB51 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc117Q6PB51 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms