Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4S6

Sik3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik3Q6P4S6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sik3Q6P4S6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sik3Q6P4S6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sik3Q6P4S6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sik3Q6P4S6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Sik3Q6P4S6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sik3Q6P4S6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sik3Q6P4S6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Sik3Q6P4S6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sik3Q6P4S6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sik3Q6P4S6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sik3Q6P4S6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sik3Q6P4S6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sik3Q6P4S6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sik3Q6P4S6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sik3Q6P4S6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Sik3Q6P4S6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sik3Q6P4S6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sik3Q6P4S6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Sik3Q6P4S6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Sik3Q6P4S6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sik3Q6P4S6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Sik3Q6P4S6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Sik3Q6P4S6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Sik3Q6P4S6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sik3Q6P4S6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Sik3Q6P4S6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sik3Q6P4S6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sik3Q6P4S6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sik3Q6P4S6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sik3Q6P4S6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sik3Q6P4S6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sik3Q6P4S6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sik3Q6P4S6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sik3Q6P4S6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Sik3Q6P4S6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sik3Q6P4S6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sik3Q6P4S6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Sik3Q6P4S6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sik3Q6P4S6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sik3Q6P4S6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sik3Q6P4S6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sik3Q6P4S6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Sik3Q6P4S6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sik3Q6P4S6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sik3Q6P4S6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Sik3Q6P4S6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sik3Q6P4S6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sik3Q6P4S6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Sik3Q6P4S6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sik3Q6P4S6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sik3Q6P4S6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sik3Q6P4S6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Sik3Q6P4S6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sik3Q6P4S6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sik3Q6P4S6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sik3Q6P4S6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sik3Q6P4S6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sik3Q6P4S6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sik3Q6P4S6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Sik3Q6P4S6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Sik3Q6P4S6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sik3Q6P4S6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sik3Q6P4S6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sik3Q6P4S6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sik3Q6P4S6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sik3Q6P4S6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sik3Q6P4S6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sik3Q6P4S6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sik3Q6P4S6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sik3Q6P4S6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sik3Q6P4S6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Sik3Q6P4S6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sik3Q6P4S6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sik3Q6P4S6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sik3Q6P4S6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Sik3Q6P4S6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sik3Q6P4S6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sik3Q6P4S6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sik3Q6P4S6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Sik3Q6P4S6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Sik3Q6P4S6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Sik3Q6P4S6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sik3Q6P4S6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sik3Q6P4S6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sik3Q6P4S6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sik3Q6P4S6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sik3Q6P4S6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sik3Q6P4S6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Sik3Q6P4S6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sik3Q6P4S6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sik3Q6P4S6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sik3Q6P4S6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sik3Q6P4S6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sik3Q6P4S6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sik3Q6P4S6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sik3Q6P4S6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sik3Q6P4S6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Sik3Q6P4S6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Sik3Q6P4S6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms