Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdac10Q6P3E7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hdac10Q6P3E7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hdac10Q6P3E7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hdac10Q6P3E7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hdac10Q6P3E7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hdac10Q6P3E7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hdac10Q6P3E7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hdac10Q6P3E7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Hdac10Q6P3E7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hdac10Q6P3E7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hdac10Q6P3E7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hdac10Q6P3E7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hdac10Q6P3E7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hdac10Q6P3E7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdac10Q6P3E7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdac10Q6P3E7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdac10Q6P3E7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdac10Q6P3E7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdac10Q6P3E7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdac10Q6P3E7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdac10Q6P3E7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hdac10Q6P3E7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hdac10Q6P3E7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hdac10Q6P3E7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hdac10Q6P3E7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hdac10Q6P3E7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hdac10Q6P3E7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hdac10Q6P3E7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hdac10Q6P3E7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hdac10Q6P3E7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hdac10Q6P3E7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hdac10Q6P3E7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Hdac10Q6P3E7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hdac10Q6P3E7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hdac10Q6P3E7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hdac10Q6P3E7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Hdac10Q6P3E7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hdac10Q6P3E7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hdac10Q6P3E7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hdac10Q6P3E7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hdac10Q6P3E7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hdac10Q6P3E7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hdac10Q6P3E7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hdac10Q6P3E7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hdac10Q6P3E7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hdac10Q6P3E7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hdac10Q6P3E7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Hdac10Q6P3E7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hdac10Q6P3E7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hdac10Q6P3E7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hdac10Q6P3E7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Hdac10Q6P3E7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hdac10Q6P3E7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hdac10Q6P3E7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hdac10Q6P3E7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hdac10Q6P3E7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hdac10Q6P3E7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hdac10Q6P3E7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hdac10Q6P3E7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hdac10Q6P3E7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hdac10Q6P3E7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hdac10Q6P3E7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hdac10Q6P3E7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hdac10Q6P3E7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hdac10Q6P3E7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hdac10Q6P3E7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hdac10Q6P3E7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hdac10Q6P3E7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Hdac10Q6P3E7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hdac10Q6P3E7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hdac10Q6P3E7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hdac10Q6P3E7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hdac10Q6P3E7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hdac10Q6P3E7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hdac10Q6P3E7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hdac10Q6P3E7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hdac10Q6P3E7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hdac10Q6P3E7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hdac10Q6P3E7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hdac10Q6P3E7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hdac10Q6P3E7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hdac10Q6P3E7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hdac10Q6P3E7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hdac10Q6P3E7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hdac10Q6P3E7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hdac10Q6P3E7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hdac10Q6P3E7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hdac10Q6P3E7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac10Q6P3E7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac10Q6P3E7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac10Q6P3E7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac10Q6P3E7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdac10Q6P3E7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdac10Q6P3E7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdac10Q6P3E7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hdac10Q6P3E7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hdac10Q6P3E7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hdac10Q6P3E7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hdac10Q6P3E7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms