Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casc4Q6P2L7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casc4Q6P2L7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casc4Q6P2L7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Casc4Q6P2L7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Casc4Q6P2L7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Casc4Q6P2L7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Casc4Q6P2L7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Casc4Q6P2L7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Casc4Q6P2L7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Casc4Q6P2L7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Casc4Q6P2L7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Casc4Q6P2L7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Casc4Q6P2L7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Casc4Q6P2L7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Casc4Q6P2L7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Casc4Q6P2L7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Casc4Q6P2L7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Casc4Q6P2L7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Casc4Q6P2L7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Casc4Q6P2L7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Casc4Q6P2L7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Casc4Q6P2L7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Casc4Q6P2L7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Casc4Q6P2L7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Casc4Q6P2L7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Casc4Q6P2L7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Casc4Q6P2L7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Casc4Q6P2L7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Casc4Q6P2L7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Casc4Q6P2L7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Casc4Q6P2L7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Casc4Q6P2L7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Casc4Q6P2L7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Casc4Q6P2L7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Casc4Q6P2L7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Casc4Q6P2L7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casc4Q6P2L7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casc4Q6P2L7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casc4Q6P2L7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casc4Q6P2L7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casc4Q6P2L7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Casc4Q6P2L7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Casc4Q6P2L7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Casc4Q6P2L7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Casc4Q6P2L7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casc4Q6P2L7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casc4Q6P2L7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casc4Q6P2L7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Casc4Q6P2L7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Casc4Q6P2L7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Casc4Q6P2L7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Casc4Q6P2L7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Casc4Q6P2L7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Casc4Q6P2L7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Casc4Q6P2L7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Casc4Q6P2L7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casc4Q6P2L7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casc4Q6P2L7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casc4Q6P2L7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casc4Q6P2L7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casc4Q6P2L7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Casc4Q6P2L7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Casc4Q6P2L7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Casc4Q6P2L7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Casc4Q6P2L7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Casc4Q6P2L7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Casc4Q6P2L7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Casc4Q6P2L7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Casc4Q6P2L7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casc4Q6P2L7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Casc4Q6P2L7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Casc4Q6P2L7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Casc4Q6P2L7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Casc4Q6P2L7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Casc4Q6P2L7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casc4Q6P2L7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casc4Q6P2L7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casc4Q6P2L7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casc4Q6P2L7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casc4Q6P2L7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casc4Q6P2L7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Casc4Q6P2L7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Casc4Q6P2L7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Casc4Q6P2L7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Casc4Q6P2L7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Casc4Q6P2L7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Casc4Q6P2L7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Casc4Q6P2L7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Casc4Q6P2L7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Casc4Q6P2L7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Casc4Q6P2L7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Casc4Q6P2L7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Casc4Q6P2L7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Casc4Q6P2L7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Casc4Q6P2L7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Casc4Q6P2L7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Casc4Q6P2L7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Casc4Q6P2L7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Casc4Q6P2L7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms