Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1I3

KICSTOR complex protein C12orf66 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P1I3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Q6P1I3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q6P1I3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q6P1I3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q6P1I3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q6P1I3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q6P1I3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q6P1I3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q6P1I3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q6P1I3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q6P1I3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Q6P1I3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q6P1I3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q6P1I3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q6P1I3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q6P1I3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q6P1I3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q6P1I3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q6P1I3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q6P1I3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q6P1I3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q6P1I3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q6P1I3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Q6P1I3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q6P1I3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q6P1I3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q6P1I3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Q6P1I3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Q6P1I3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q6P1I3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q6P1I3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q6P1I3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q6P1I3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q6P1I3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q6P1I3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q6P1I3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q6P1I3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q6P1I3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q6P1I3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q6P1I3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q6P1I3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q6P1I3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q6P1I3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q6P1I3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q6P1I3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q6P1I3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Q6P1I3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q6P1I3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q6P1I3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q6P1I3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Q6P1I3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q6P1I3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q6P1I3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q6P1I3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q6P1I3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q6P1I3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q6P1I3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q6P1I3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q6P1I3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q6P1I3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q6P1I3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Q6P1I3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q6P1I3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q6P1I3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q6P1I3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Q6P1I3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q6P1I3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q6P1I3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q6P1I3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q6P1I3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q6P1I3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q6P1I3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q6P1I3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q6P1I3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q6P1I3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q6P1I3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q6P1I3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q6P1I3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q6P1I3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q6P1I3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q6P1I3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q6P1I3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q6P1I3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q6P1I3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Q6P1I3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Q6P1I3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q6P1I3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q6P1I3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q6P1I3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q6P1I3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q6P1I3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q6P1I3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q6P1I3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q6P1I3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q6P1I3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Q6P1I3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q6P1I3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q6P1I3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q6P1I3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q6P1I3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms