Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZA9

Taf9b, Transcription initiation factor TFIID subunit 9B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf9bQ6NZA9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf9bQ6NZA9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf9bQ6NZA9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf9bQ6NZA9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf9bQ6NZA9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf9bQ6NZA9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf9bQ6NZA9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf9bQ6NZA9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf9bQ6NZA9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Taf9bQ6NZA9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Taf9bQ6NZA9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Taf9bQ6NZA9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Taf9bQ6NZA9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Taf9bQ6NZA9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Taf9bQ6NZA9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Taf9bQ6NZA9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Taf9bQ6NZA9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Taf9bQ6NZA9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Taf9bQ6NZA9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Taf9bQ6NZA9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Taf9bQ6NZA9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Taf9bQ6NZA9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Taf9bQ6NZA9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Taf9bQ6NZA9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Taf9bQ6NZA9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Taf9bQ6NZA9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Taf9bQ6NZA9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Taf9bQ6NZA9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Taf9bQ6NZA9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Taf9bQ6NZA9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Taf9bQ6NZA9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Taf9bQ6NZA9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Taf9bQ6NZA9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Taf9bQ6NZA9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Taf9bQ6NZA9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Taf9bQ6NZA9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Taf9bQ6NZA9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Taf9bQ6NZA9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Taf9bQ6NZA9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Taf9bQ6NZA9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Taf9bQ6NZA9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Taf9bQ6NZA9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Taf9bQ6NZA9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Taf9bQ6NZA9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Taf9bQ6NZA9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Taf9bQ6NZA9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Taf9bQ6NZA9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Taf9bQ6NZA9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Taf9bQ6NZA9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Taf9bQ6NZA9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Taf9bQ6NZA9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Taf9bQ6NZA9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Taf9bQ6NZA9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Taf9bQ6NZA9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Taf9bQ6NZA9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Taf9bQ6NZA9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Taf9bQ6NZA9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Taf9bQ6NZA9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Taf9bQ6NZA9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Taf9bQ6NZA9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Taf9bQ6NZA9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Taf9bQ6NZA9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Taf9bQ6NZA9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Taf9bQ6NZA9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Taf9bQ6NZA9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Taf9bQ6NZA9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Taf9bQ6NZA9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Taf9bQ6NZA9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Taf9bQ6NZA9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Taf9bQ6NZA9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Taf9bQ6NZA9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Taf9bQ6NZA9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Taf9bQ6NZA9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Taf9bQ6NZA9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Taf9bQ6NZA9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Taf9bQ6NZA9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Taf9bQ6NZA9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Taf9bQ6NZA9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Taf9bQ6NZA9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Taf9bQ6NZA9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Taf9bQ6NZA9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Taf9bQ6NZA9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Taf9bQ6NZA9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Taf9bQ6NZA9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Taf9bQ6NZA9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Taf9bQ6NZA9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Taf9bQ6NZA9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Taf9bQ6NZA9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Taf9bQ6NZA9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Taf9bQ6NZA9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Taf9bQ6NZA9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Taf9bQ6NZA9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Taf9bQ6NZA9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Taf9bQ6NZA9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Taf9bQ6NZA9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Taf9bQ6NZA9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Taf9bQ6NZA9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Taf9bQ6NZA9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Taf9bQ6NZA9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Taf9bQ6NZA9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms