Protein–RNA interactions for Protein: Q6NY15

Tsga10, Testis-specific gene 10 protein, mousemouse

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsga10Q6NY15 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Tsga10Q6NY15 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tsga10Q6NY15 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tsga10Q6NY15 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tsga10Q6NY15 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tsga10Q6NY15 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tsga10Q6NY15 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tsga10Q6NY15 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tsga10Q6NY15 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tsga10Q6NY15 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tsga10Q6NY15 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tsga10Q6NY15 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tsga10Q6NY15 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tsga10Q6NY15 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tsga10Q6NY15 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tsga10Q6NY15 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tsga10Q6NY15 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsga10Q6NY15 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsga10Q6NY15 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsga10Q6NY15 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsga10Q6NY15 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsga10Q6NY15 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tsga10Q6NY15 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tsga10Q6NY15 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tsga10Q6NY15 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tsga10Q6NY15 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tsga10Q6NY15 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tsga10Q6NY15 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tsga10Q6NY15 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tsga10Q6NY15 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tsga10Q6NY15 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tsga10Q6NY15 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tsga10Q6NY15 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tsga10Q6NY15 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tsga10Q6NY15 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tsga10Q6NY15 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tsga10Q6NY15 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tsga10Q6NY15 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tsga10Q6NY15 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tsga10Q6NY15 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tsga10Q6NY15 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tsga10Q6NY15 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tsga10Q6NY15 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tsga10Q6NY15 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tsga10Q6NY15 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tsga10Q6NY15 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tsga10Q6NY15 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tsga10Q6NY15 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tsga10Q6NY15 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tsga10Q6NY15 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tsga10Q6NY15 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tsga10Q6NY15 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tsga10Q6NY15 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tsga10Q6NY15 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tsga10Q6NY15 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tsga10Q6NY15 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tsga10Q6NY15 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tsga10Q6NY15 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tsga10Q6NY15 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tsga10Q6NY15 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tsga10Q6NY15 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tsga10Q6NY15 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tsga10Q6NY15 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tsga10Q6NY15 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tsga10Q6NY15 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tsga10Q6NY15 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tsga10Q6NY15 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tsga10Q6NY15 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tsga10Q6NY15 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tsga10Q6NY15 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tsga10Q6NY15 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tsga10Q6NY15 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tsga10Q6NY15 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tsga10Q6NY15 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tsga10Q6NY15 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tsga10Q6NY15 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tsga10Q6NY15 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tsga10Q6NY15 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tsga10Q6NY15 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tsga10Q6NY15 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tsga10Q6NY15 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tsga10Q6NY15 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tsga10Q6NY15 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tsga10Q6NY15 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tsga10Q6NY15 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tsga10Q6NY15 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tsga10Q6NY15 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tsga10Q6NY15 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tsga10Q6NY15 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tsga10Q6NY15 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tsga10Q6NY15 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tsga10Q6NY15 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tsga10Q6NY15 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tsga10Q6NY15 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tsga10Q6NY15 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tsga10Q6NY15 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tsga10Q6NY15 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tsga10Q6NY15 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tsga10Q6NY15 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tsga10Q6NY15 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms