Protein–RNA interactions for Protein: Q6GSS7

Hist2h2aa1, Histone H2A type 2-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2aa1Q6GSS7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hist2h2aa1Q6GSS7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hist2h2aa1Q6GSS7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hist2h2aa1Q6GSS7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hist2h2aa1Q6GSS7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hist2h2aa1Q6GSS7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hist2h2aa1Q6GSS7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hist2h2aa1Q6GSS7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hist2h2aa1Q6GSS7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hist2h2aa1Q6GSS7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hist2h2aa1Q6GSS7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Hist2h2aa1Q6GSS7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hist2h2aa1Q6GSS7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hist2h2aa1Q6GSS7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hist2h2aa1Q6GSS7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hist2h2aa1Q6GSS7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hist2h2aa1Q6GSS7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hist2h2aa1Q6GSS7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Hist2h2aa1Q6GSS7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hist2h2aa1Q6GSS7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hist2h2aa1Q6GSS7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hist2h2aa1Q6GSS7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hist2h2aa1Q6GSS7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms