Protein–RNA interactions for Protein: Q6DVA0

Lemd2, LEM domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd2Q6DVA0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lemd2Q6DVA0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lemd2Q6DVA0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lemd2Q6DVA0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lemd2Q6DVA0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lemd2Q6DVA0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lemd2Q6DVA0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Lemd2Q6DVA0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lemd2Q6DVA0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lemd2Q6DVA0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lemd2Q6DVA0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Lemd2Q6DVA0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Lemd2Q6DVA0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Lemd2Q6DVA0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Lemd2Q6DVA0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lemd2Q6DVA0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lemd2Q6DVA0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lemd2Q6DVA0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lemd2Q6DVA0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lemd2Q6DVA0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lemd2Q6DVA0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lemd2Q6DVA0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lemd2Q6DVA0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lemd2Q6DVA0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lemd2Q6DVA0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lemd2Q6DVA0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lemd2Q6DVA0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lemd2Q6DVA0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lemd2Q6DVA0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lemd2Q6DVA0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Lemd2Q6DVA0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lemd2Q6DVA0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lemd2Q6DVA0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lemd2Q6DVA0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Lemd2Q6DVA0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lemd2Q6DVA0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lemd2Q6DVA0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lemd2Q6DVA0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Lemd2Q6DVA0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lemd2Q6DVA0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Lemd2Q6DVA0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lemd2Q6DVA0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lemd2Q6DVA0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lemd2Q6DVA0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lemd2Q6DVA0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lemd2Q6DVA0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lemd2Q6DVA0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lemd2Q6DVA0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lemd2Q6DVA0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Lemd2Q6DVA0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lemd2Q6DVA0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lemd2Q6DVA0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lemd2Q6DVA0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lemd2Q6DVA0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lemd2Q6DVA0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lemd2Q6DVA0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lemd2Q6DVA0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lemd2Q6DVA0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lemd2Q6DVA0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lemd2Q6DVA0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lemd2Q6DVA0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lemd2Q6DVA0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lemd2Q6DVA0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lemd2Q6DVA0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lemd2Q6DVA0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Lemd2Q6DVA0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lemd2Q6DVA0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Lemd2Q6DVA0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lemd2Q6DVA0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lemd2Q6DVA0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Lemd2Q6DVA0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lemd2Q6DVA0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lemd2Q6DVA0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lemd2Q6DVA0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lemd2Q6DVA0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lemd2Q6DVA0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Lemd2Q6DVA0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lemd2Q6DVA0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lemd2Q6DVA0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lemd2Q6DVA0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lemd2Q6DVA0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lemd2Q6DVA0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lemd2Q6DVA0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lemd2Q6DVA0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lemd2Q6DVA0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Lemd2Q6DVA0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lemd2Q6DVA0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lemd2Q6DVA0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lemd2Q6DVA0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lemd2Q6DVA0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lemd2Q6DVA0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lemd2Q6DVA0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lemd2Q6DVA0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lemd2Q6DVA0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lemd2Q6DVA0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lemd2Q6DVA0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lemd2Q6DVA0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lemd2Q6DVA0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lemd2Q6DVA0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lemd2Q6DVA0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms