Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG3

Spty2d1, Protein SPT2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spty2d1Q68FG3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Spty2d1Q68FG3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Spty2d1Q68FG3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Spty2d1Q68FG3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Spty2d1Q68FG3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Spty2d1Q68FG3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Spty2d1Q68FG3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Spty2d1Q68FG3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Spty2d1Q68FG3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Spty2d1Q68FG3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Spty2d1Q68FG3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Spty2d1Q68FG3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Spty2d1Q68FG3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Spty2d1Q68FG3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Spty2d1Q68FG3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Spty2d1Q68FG3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Spty2d1Q68FG3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Spty2d1Q68FG3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Spty2d1Q68FG3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Spty2d1Q68FG3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Spty2d1Q68FG3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Spty2d1Q68FG3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Spty2d1Q68FG3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Spty2d1Q68FG3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Spty2d1Q68FG3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Spty2d1Q68FG3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Spty2d1Q68FG3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Spty2d1Q68FG3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Spty2d1Q68FG3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Spty2d1Q68FG3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Spty2d1Q68FG3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Spty2d1Q68FG3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Spty2d1Q68FG3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Spty2d1Q68FG3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Spty2d1Q68FG3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Spty2d1Q68FG3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Spty2d1Q68FG3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Spty2d1Q68FG3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Spty2d1Q68FG3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Spty2d1Q68FG3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Spty2d1Q68FG3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Spty2d1Q68FG3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Spty2d1Q68FG3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Spty2d1Q68FG3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Spty2d1Q68FG3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Spty2d1Q68FG3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Spty2d1Q68FG3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Spty2d1Q68FG3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Spty2d1Q68FG3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Spty2d1Q68FG3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Spty2d1Q68FG3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Spty2d1Q68FG3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Spty2d1Q68FG3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Spty2d1Q68FG3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Spty2d1Q68FG3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Spty2d1Q68FG3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Spty2d1Q68FG3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Spty2d1Q68FG3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Spty2d1Q68FG3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Spty2d1Q68FG3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Spty2d1Q68FG3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Spty2d1Q68FG3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Spty2d1Q68FG3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Spty2d1Q68FG3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Spty2d1Q68FG3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Spty2d1Q68FG3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Spty2d1Q68FG3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Spty2d1Q68FG3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Spty2d1Q68FG3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Spty2d1Q68FG3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Spty2d1Q68FG3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Spty2d1Q68FG3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Spty2d1Q68FG3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Spty2d1Q68FG3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Spty2d1Q68FG3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Spty2d1Q68FG3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Spty2d1Q68FG3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Spty2d1Q68FG3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Spty2d1Q68FG3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Spty2d1Q68FG3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Spty2d1Q68FG3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Spty2d1Q68FG3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Spty2d1Q68FG3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Spty2d1Q68FG3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Spty2d1Q68FG3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Spty2d1Q68FG3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Spty2d1Q68FG3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Spty2d1Q68FG3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Spty2d1Q68FG3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Spty2d1Q68FG3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Spty2d1Q68FG3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Spty2d1Q68FG3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Spty2d1Q68FG3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Spty2d1Q68FG3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Spty2d1Q68FG3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Spty2d1Q68FG3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Spty2d1Q68FG3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Spty2d1Q68FG3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Spty2d1Q68FG3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Spty2d1Q68FG3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms