Protein–RNA interactions for Protein: Q67DU8

Clec4b2, Antigen presenting cell lectin-like receptor A1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4b2Q67DU8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clec4b2Q67DU8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clec4b2Q67DU8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clec4b2Q67DU8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clec4b2Q67DU8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clec4b2Q67DU8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Clec4b2Q67DU8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clec4b2Q67DU8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clec4b2Q67DU8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clec4b2Q67DU8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Clec4b2Q67DU8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clec4b2Q67DU8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clec4b2Q67DU8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clec4b2Q67DU8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Clec4b2Q67DU8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clec4b2Q67DU8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clec4b2Q67DU8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clec4b2Q67DU8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clec4b2Q67DU8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec4b2Q67DU8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec4b2Q67DU8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec4b2Q67DU8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec4b2Q67DU8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec4b2Q67DU8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec4b2Q67DU8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Clec4b2Q67DU8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clec4b2Q67DU8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clec4b2Q67DU8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clec4b2Q67DU8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clec4b2Q67DU8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clec4b2Q67DU8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clec4b2Q67DU8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Clec4b2Q67DU8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clec4b2Q67DU8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clec4b2Q67DU8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clec4b2Q67DU8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clec4b2Q67DU8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clec4b2Q67DU8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clec4b2Q67DU8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clec4b2Q67DU8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clec4b2Q67DU8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clec4b2Q67DU8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clec4b2Q67DU8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clec4b2Q67DU8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clec4b2Q67DU8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clec4b2Q67DU8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clec4b2Q67DU8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clec4b2Q67DU8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clec4b2Q67DU8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clec4b2Q67DU8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clec4b2Q67DU8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clec4b2Q67DU8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Clec4b2Q67DU8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clec4b2Q67DU8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clec4b2Q67DU8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clec4b2Q67DU8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clec4b2Q67DU8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clec4b2Q67DU8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clec4b2Q67DU8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clec4b2Q67DU8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clec4b2Q67DU8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clec4b2Q67DU8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clec4b2Q67DU8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clec4b2Q67DU8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clec4b2Q67DU8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clec4b2Q67DU8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clec4b2Q67DU8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clec4b2Q67DU8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clec4b2Q67DU8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clec4b2Q67DU8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clec4b2Q67DU8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clec4b2Q67DU8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clec4b2Q67DU8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clec4b2Q67DU8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clec4b2Q67DU8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clec4b2Q67DU8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clec4b2Q67DU8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clec4b2Q67DU8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Clec4b2Q67DU8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clec4b2Q67DU8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clec4b2Q67DU8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clec4b2Q67DU8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clec4b2Q67DU8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clec4b2Q67DU8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clec4b2Q67DU8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clec4b2Q67DU8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clec4b2Q67DU8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clec4b2Q67DU8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clec4b2Q67DU8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clec4b2Q67DU8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clec4b2Q67DU8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clec4b2Q67DU8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clec4b2Q67DU8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clec4b2Q67DU8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clec4b2Q67DU8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clec4b2Q67DU8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clec4b2Q67DU8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clec4b2Q67DU8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clec4b2Q67DU8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clec4b2Q67DU8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms