Protein–RNA interactions for Protein: Q64524

Hist2h2be, Histone H2B type 2-E, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2beQ64524 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hist2h2beQ64524 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hist2h2beQ64524 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hist2h2beQ64524 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hist2h2beQ64524 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hist2h2beQ64524 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hist2h2beQ64524 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hist2h2beQ64524 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hist2h2beQ64524 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hist2h2beQ64524 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hist2h2beQ64524 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hist2h2beQ64524 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hist2h2beQ64524 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hist2h2beQ64524 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hist2h2beQ64524 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hist2h2beQ64524 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hist2h2beQ64524 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hist2h2beQ64524 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hist2h2beQ64524 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hist2h2beQ64524 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hist2h2beQ64524 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hist2h2beQ64524 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hist2h2beQ64524 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hist2h2beQ64524 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hist2h2beQ64524 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hist2h2beQ64524 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hist2h2beQ64524 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hist2h2beQ64524 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hist2h2beQ64524 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hist2h2beQ64524 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hist2h2beQ64524 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hist2h2beQ64524 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hist2h2beQ64524 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hist2h2beQ64524 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hist2h2beQ64524 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hist2h2beQ64524 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hist2h2beQ64524 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hist2h2beQ64524 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hist2h2beQ64524 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hist2h2beQ64524 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hist2h2beQ64524 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hist2h2beQ64524 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hist2h2beQ64524 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hist2h2beQ64524 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hist2h2beQ64524 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hist2h2beQ64524 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hist2h2beQ64524 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hist2h2beQ64524 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hist2h2beQ64524 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hist2h2beQ64524 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hist2h2beQ64524 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hist2h2beQ64524 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hist2h2beQ64524 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hist2h2beQ64524 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hist2h2beQ64524 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hist2h2beQ64524 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hist2h2beQ64524 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hist2h2beQ64524 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hist2h2beQ64524 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hist2h2beQ64524 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hist2h2beQ64524 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hist2h2beQ64524 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hist2h2beQ64524 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hist2h2beQ64524 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hist2h2beQ64524 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hist2h2beQ64524 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hist2h2beQ64524 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hist2h2beQ64524 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hist2h2beQ64524 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hist2h2beQ64524 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hist2h2beQ64524 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hist2h2beQ64524 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hist2h2beQ64524 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hist2h2beQ64524 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hist2h2beQ64524 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hist2h2beQ64524 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hist2h2beQ64524 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hist2h2beQ64524 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hist2h2beQ64524 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hist2h2beQ64524 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hist2h2beQ64524 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hist2h2beQ64524 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hist2h2beQ64524 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hist2h2beQ64524 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hist2h2beQ64524 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hist2h2beQ64524 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hist2h2beQ64524 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hist2h2beQ64524 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hist2h2beQ64524 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hist2h2beQ64524 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hist2h2beQ64524 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hist2h2beQ64524 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hist2h2beQ64524 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hist2h2beQ64524 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hist2h2beQ64524 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hist2h2beQ64524 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hist2h2beQ64524 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hist2h2beQ64524 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hist2h2beQ64524 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hist2h2beQ64524 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms