Protein–RNA interactions for Protein: Q64518

Atp2a3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a3Q64518 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2a3Q64518 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2a3Q64518 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2a3Q64518 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2a3Q64518 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp2a3Q64518 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp2a3Q64518 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp2a3Q64518 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp2a3Q64518 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp2a3Q64518 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp2a3Q64518 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp2a3Q64518 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp2a3Q64518 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atp2a3Q64518 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Atp2a3Q64518 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp2a3Q64518 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp2a3Q64518 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp2a3Q64518 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp2a3Q64518 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp2a3Q64518 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp2a3Q64518 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp2a3Q64518 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp2a3Q64518 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp2a3Q64518 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp2a3Q64518 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp2a3Q64518 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp2a3Q64518 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp2a3Q64518 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp2a3Q64518 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp2a3Q64518 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp2a3Q64518 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp2a3Q64518 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp2a3Q64518 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2a3Q64518 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2a3Q64518 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2a3Q64518 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2a3Q64518 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2a3Q64518 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2a3Q64518 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp2a3Q64518 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp2a3Q64518 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp2a3Q64518 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp2a3Q64518 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2a3Q64518 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2a3Q64518 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2a3Q64518 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2a3Q64518 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2a3Q64518 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2a3Q64518 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2a3Q64518 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp2a3Q64518 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2a3Q64518 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2a3Q64518 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2a3Q64518 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2a3Q64518 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2a3Q64518 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2a3Q64518 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp2a3Q64518 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp2a3Q64518 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp2a3Q64518 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp2a3Q64518 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp2a3Q64518 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp2a3Q64518 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp2a3Q64518 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp2a3Q64518 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp2a3Q64518 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp2a3Q64518 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp2a3Q64518 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp2a3Q64518 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp2a3Q64518 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp2a3Q64518 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp2a3Q64518 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp2a3Q64518 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp2a3Q64518 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp2a3Q64518 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp2a3Q64518 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp2a3Q64518 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp2a3Q64518 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp2a3Q64518 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp2a3Q64518 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp2a3Q64518 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp2a3Q64518 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp2a3Q64518 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp2a3Q64518 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp2a3Q64518 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp2a3Q64518 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp2a3Q64518 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp2a3Q64518 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp2a3Q64518 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp2a3Q64518 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp2a3Q64518 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp2a3Q64518 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp2a3Q64518 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp2a3Q64518 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp2a3Q64518 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp2a3Q64518 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp2a3Q64518 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp2a3Q64518 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp2a3Q64518 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp2a3Q64518 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms