Protein–RNA interactions for Protein: Q64104

Nr2e1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e1Q64104 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nr2e1Q64104 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nr2e1Q64104 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nr2e1Q64104 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nr2e1Q64104 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nr2e1Q64104 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nr2e1Q64104 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nr2e1Q64104 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nr2e1Q64104 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nr2e1Q64104 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nr2e1Q64104 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nr2e1Q64104 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nr2e1Q64104 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nr2e1Q64104 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nr2e1Q64104 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nr2e1Q64104 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nr2e1Q64104 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nr2e1Q64104 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nr2e1Q64104 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nr2e1Q64104 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nr2e1Q64104 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nr2e1Q64104 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nr2e1Q64104 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Nr2e1Q64104 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nr2e1Q64104 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nr2e1Q64104 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nr2e1Q64104 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nr2e1Q64104 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nr2e1Q64104 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nr2e1Q64104 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nr2e1Q64104 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nr2e1Q64104 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nr2e1Q64104 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nr2e1Q64104 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nr2e1Q64104 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nr2e1Q64104 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nr2e1Q64104 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nr2e1Q64104 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nr2e1Q64104 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Nr2e1Q64104 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nr2e1Q64104 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nr2e1Q64104 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nr2e1Q64104 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nr2e1Q64104 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nr2e1Q64104 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nr2e1Q64104 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nr2e1Q64104 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nr2e1Q64104 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nr2e1Q64104 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nr2e1Q64104 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nr2e1Q64104 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nr2e1Q64104 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nr2e1Q64104 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nr2e1Q64104 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nr2e1Q64104 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nr2e1Q64104 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nr2e1Q64104 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nr2e1Q64104 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Nr2e1Q64104 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nr2e1Q64104 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nr2e1Q64104 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nr2e1Q64104 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nr2e1Q64104 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nr2e1Q64104 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nr2e1Q64104 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nr2e1Q64104 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nr2e1Q64104 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nr2e1Q64104 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nr2e1Q64104 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nr2e1Q64104 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nr2e1Q64104 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nr2e1Q64104 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nr2e1Q64104 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nr2e1Q64104 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nr2e1Q64104 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nr2e1Q64104 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nr2e1Q64104 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nr2e1Q64104 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nr2e1Q64104 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nr2e1Q64104 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nr2e1Q64104 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nr2e1Q64104 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nr2e1Q64104 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nr2e1Q64104 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Nr2e1Q64104 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nr2e1Q64104 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nr2e1Q64104 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Nr2e1Q64104 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nr2e1Q64104 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nr2e1Q64104 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nr2e1Q64104 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nr2e1Q64104 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nr2e1Q64104 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nr2e1Q64104 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nr2e1Q64104 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nr2e1Q64104 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nr2e1Q64104 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nr2e1Q64104 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nr2e1Q64104 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nr2e1Q64104 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms