Protein–RNA interactions for Protein: Q640M6

Gdpd5, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd5Q640M6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gdpd5Q640M6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gdpd5Q640M6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gdpd5Q640M6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gdpd5Q640M6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gdpd5Q640M6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gdpd5Q640M6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gdpd5Q640M6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gdpd5Q640M6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gdpd5Q640M6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gdpd5Q640M6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gdpd5Q640M6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gdpd5Q640M6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gdpd5Q640M6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gdpd5Q640M6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gdpd5Q640M6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Gdpd5Q640M6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gdpd5Q640M6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gdpd5Q640M6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gdpd5Q640M6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gdpd5Q640M6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gdpd5Q640M6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gdpd5Q640M6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gdpd5Q640M6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gdpd5Q640M6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gdpd5Q640M6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gdpd5Q640M6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gdpd5Q640M6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gdpd5Q640M6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gdpd5Q640M6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gdpd5Q640M6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gdpd5Q640M6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gdpd5Q640M6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gdpd5Q640M6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gdpd5Q640M6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gdpd5Q640M6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gdpd5Q640M6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gdpd5Q640M6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gdpd5Q640M6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gdpd5Q640M6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gdpd5Q640M6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gdpd5Q640M6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gdpd5Q640M6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gdpd5Q640M6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gdpd5Q640M6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gdpd5Q640M6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gdpd5Q640M6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gdpd5Q640M6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gdpd5Q640M6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gdpd5Q640M6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gdpd5Q640M6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gdpd5Q640M6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gdpd5Q640M6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gdpd5Q640M6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gdpd5Q640M6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gdpd5Q640M6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gdpd5Q640M6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gdpd5Q640M6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gdpd5Q640M6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gdpd5Q640M6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gdpd5Q640M6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gdpd5Q640M6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gdpd5Q640M6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gdpd5Q640M6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gdpd5Q640M6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gdpd5Q640M6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gdpd5Q640M6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gdpd5Q640M6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gdpd5Q640M6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gdpd5Q640M6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gdpd5Q640M6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gdpd5Q640M6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gdpd5Q640M6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gdpd5Q640M6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gdpd5Q640M6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gdpd5Q640M6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gdpd5Q640M6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gdpd5Q640M6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gdpd5Q640M6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gdpd5Q640M6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gdpd5Q640M6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gdpd5Q640M6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gdpd5Q640M6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gdpd5Q640M6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gdpd5Q640M6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gdpd5Q640M6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gdpd5Q640M6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gdpd5Q640M6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gdpd5Q640M6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gdpd5Q640M6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gdpd5Q640M6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gdpd5Q640M6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gdpd5Q640M6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gdpd5Q640M6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gdpd5Q640M6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gdpd5Q640M6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gdpd5Q640M6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gdpd5Q640M6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gdpd5Q640M6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gdpd5Q640M6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms