Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Ccdc18Q640L5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Ccdc18Q640L5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
Ccdc18Q640L5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Ccdc18Q640L5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Ccdc18Q640L5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
Ccdc18Q640L5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Ccdc18Q640L5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Ccdc18Q640L5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
Ccdc18Q640L5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Ccdc18Q640L5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
Ccdc18Q640L5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
Ccdc18Q640L5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Ccdc18Q640L5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
Ccdc18Q640L5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
Ccdc18Q640L5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Ccdc18Q640L5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
Ccdc18Q640L5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
Ccdc18Q640L5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
Ccdc18Q640L5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC39.34■■■■□ 3.89
Ccdc18Q640L5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC39.32■■■■□ 3.89
Ccdc18Q640L5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
Ccdc18Q640L5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
Ccdc18Q640L5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Ccdc18Q640L5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
Ccdc18Q640L5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
Ccdc18Q640L5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Ccdc18Q640L5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Ccdc18Q640L5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Ccdc18Q640L5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC39.28■■■■□ 3.88
Ccdc18Q640L5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC39.27■■■■□ 3.88
Ccdc18Q640L5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC39.27■■■■□ 3.88
Ccdc18Q640L5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Ccdc18Q640L5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Ccdc18Q640L5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC39.25■■■■□ 3.87
Ccdc18Q640L5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Ccdc18Q640L5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Ccdc18Q640L5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Ccdc18Q640L5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Ccdc18Q640L5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
Ccdc18Q640L5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Ccdc18Q640L5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
Ccdc18Q640L5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Ccdc18Q640L5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Ccdc18Q640L5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Ccdc18Q640L5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Ccdc18Q640L5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Ccdc18Q640L5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Ccdc18Q640L5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Ccdc18Q640L5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
Ccdc18Q640L5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Ccdc18Q640L5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
Ccdc18Q640L5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Ccdc18Q640L5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Ccdc18Q640L5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Ccdc18Q640L5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
Ccdc18Q640L5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
Ccdc18Q640L5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Ccdc18Q640L5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Ccdc18Q640L5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Ccdc18Q640L5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Ccdc18Q640L5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Ccdc18Q640L5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Ccdc18Q640L5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
Ccdc18Q640L5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
Ccdc18Q640L5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Ccdc18Q640L5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Ccdc18Q640L5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Ccdc18Q640L5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC39.11■■■■□ 3.85
Ccdc18Q640L5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
Ccdc18Q640L5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
Ccdc18Q640L5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Ccdc18Q640L5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
Ccdc18Q640L5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Ccdc18Q640L5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
Ccdc18Q640L5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
Ccdc18Q640L5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Ccdc18Q640L5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
Ccdc18Q640L5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Ccdc18Q640L5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
Ccdc18Q640L5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Ccdc18Q640L5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Ccdc18Q640L5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC39■■■■□ 3.83
Ccdc18Q640L5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Ccdc18Q640L5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Ccdc18Q640L5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
Ccdc18Q640L5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
Ccdc18Q640L5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Ccdc18Q640L5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Ccdc18Q640L5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Ccdc18Q640L5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Ccdc18Q640L5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
Ccdc18Q640L5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Ccdc18Q640L5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Ccdc18Q640L5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Ccdc18Q640L5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Ccdc18Q640L5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
Ccdc18Q640L5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Ccdc18Q640L5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Ccdc18Q640L5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC38.9■■■■□ 3.82
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