Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tpd52Q62393 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tpd52Q62393 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tpd52Q62393 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tpd52Q62393 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Tpd52Q62393 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tpd52Q62393 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tpd52Q62393 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tpd52Q62393 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Tpd52Q62393 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tpd52Q62393 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tpd52Q62393 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tpd52Q62393 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tpd52Q62393 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tpd52Q62393 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tpd52Q62393 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Tpd52Q62393 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tpd52Q62393 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Tpd52Q62393 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tpd52Q62393 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tpd52Q62393 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tpd52Q62393 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tpd52Q62393 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Tpd52Q62393 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tpd52Q62393 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tpd52Q62393 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tpd52Q62393 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tpd52Q62393 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tpd52Q62393 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tpd52Q62393 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tpd52Q62393 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tpd52Q62393 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tpd52Q62393 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tpd52Q62393 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tpd52Q62393 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tpd52Q62393 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tpd52Q62393 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tpd52Q62393 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tpd52Q62393 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tpd52Q62393 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tpd52Q62393 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tpd52Q62393 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tpd52Q62393 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tpd52Q62393 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Tpd52Q62393 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tpd52Q62393 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tpd52Q62393 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tpd52Q62393 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Tpd52Q62393 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tpd52Q62393 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Tpd52Q62393 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Tpd52Q62393 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tpd52Q62393 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tpd52Q62393 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tpd52Q62393 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tpd52Q62393 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tpd52Q62393 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tpd52Q62393 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tpd52Q62393 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tpd52Q62393 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tpd52Q62393 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Tpd52Q62393 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tpd52Q62393 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tpd52Q62393 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tpd52Q62393 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tpd52Q62393 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tpd52Q62393 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tpd52Q62393 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Tpd52Q62393 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tpd52Q62393 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tpd52Q62393 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tpd52Q62393 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tpd52Q62393 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tpd52Q62393 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tpd52Q62393 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tpd52Q62393 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tpd52Q62393 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tpd52Q62393 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tpd52Q62393 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tpd52Q62393 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tpd52Q62393 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tpd52Q62393 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tpd52Q62393 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tpd52Q62393 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tpd52Q62393 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tpd52Q62393 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tpd52Q62393 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tpd52Q62393 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tpd52Q62393 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tpd52Q62393 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tpd52Q62393 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tpd52Q62393 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tpd52Q62393 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tpd52Q62393 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tpd52Q62393 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tpd52Q62393 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tpd52Q62393 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tpd52Q62393 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tpd52Q62393 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tpd52Q62393 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms