Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SypQ62277 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SypQ62277 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SypQ62277 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SypQ62277 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SypQ62277 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SypQ62277 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SypQ62277 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SypQ62277 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SypQ62277 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SypQ62277 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SypQ62277 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SypQ62277 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SypQ62277 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SypQ62277 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SypQ62277 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SypQ62277 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SypQ62277 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SypQ62277 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SypQ62277 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SypQ62277 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SypQ62277 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SypQ62277 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SypQ62277 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SypQ62277 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SypQ62277 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SypQ62277 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SypQ62277 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SypQ62277 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SypQ62277 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SypQ62277 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SypQ62277 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SypQ62277 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SypQ62277 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SypQ62277 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SypQ62277 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SypQ62277 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SypQ62277 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SypQ62277 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SypQ62277 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SypQ62277 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SypQ62277 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SypQ62277 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SypQ62277 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SypQ62277 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SypQ62277 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SypQ62277 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SypQ62277 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SypQ62277 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SypQ62277 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SypQ62277 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SypQ62277 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SypQ62277 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SypQ62277 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SypQ62277 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SypQ62277 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SypQ62277 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SypQ62277 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SypQ62277 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SypQ62277 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SypQ62277 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SypQ62277 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SypQ62277 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SypQ62277 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SypQ62277 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SypQ62277 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SypQ62277 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SypQ62277 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SypQ62277 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SypQ62277 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SypQ62277 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SypQ62277 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SypQ62277 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SypQ62277 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SypQ62277 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SypQ62277 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SypQ62277 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SypQ62277 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SypQ62277 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SypQ62277 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SypQ62277 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SypQ62277 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SypQ62277 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SypQ62277 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SypQ62277 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SypQ62277 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SypQ62277 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SypQ62277 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SypQ62277 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SypQ62277 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SypQ62277 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SypQ62277 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SypQ62277 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SypQ62277 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SypQ62277 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SypQ62277 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SypQ62277 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SypQ62277 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SypQ62277 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SypQ62277 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms