Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sprr1bQ62267 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sprr1bQ62267 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sprr1bQ62267 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sprr1bQ62267 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sprr1bQ62267 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sprr1bQ62267 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sprr1bQ62267 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sprr1bQ62267 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sprr1bQ62267 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sprr1bQ62267 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sprr1bQ62267 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sprr1bQ62267 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sprr1bQ62267 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sprr1bQ62267 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sprr1bQ62267 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sprr1bQ62267 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sprr1bQ62267 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sprr1bQ62267 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sprr1bQ62267 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sprr1bQ62267 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sprr1bQ62267 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sprr1bQ62267 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sprr1bQ62267 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sprr1bQ62267 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sprr1bQ62267 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sprr1bQ62267 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sprr1bQ62267 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sprr1bQ62267 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sprr1bQ62267 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sprr1bQ62267 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sprr1bQ62267 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sprr1bQ62267 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sprr1bQ62267 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sprr1bQ62267 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sprr1bQ62267 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sprr1bQ62267 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sprr1bQ62267 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sprr1bQ62267 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sprr1bQ62267 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sprr1bQ62267 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sprr1bQ62267 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sprr1bQ62267 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sprr1bQ62267 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sprr1bQ62267 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sprr1bQ62267 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sprr1bQ62267 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sprr1bQ62267 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sprr1bQ62267 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sprr1bQ62267 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sprr1bQ62267 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sprr1bQ62267 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sprr1bQ62267 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sprr1bQ62267 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sprr1bQ62267 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sprr1bQ62267 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sprr1bQ62267 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sprr1bQ62267 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sprr1bQ62267 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sprr1bQ62267 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sprr1bQ62267 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sprr1bQ62267 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sprr1bQ62267 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sprr1bQ62267 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sprr1bQ62267 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sprr1bQ62267 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sprr1bQ62267 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sprr1bQ62267 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sprr1bQ62267 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sprr1bQ62267 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sprr1bQ62267 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sprr1bQ62267 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sprr1bQ62267 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sprr1bQ62267 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sprr1bQ62267 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sprr1bQ62267 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sprr1bQ62267 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sprr1bQ62267 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sprr1bQ62267 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sprr1bQ62267 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sprr1bQ62267 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sprr1bQ62267 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sprr1bQ62267 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sprr1bQ62267 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sprr1bQ62267 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sprr1bQ62267 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sprr1bQ62267 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sprr1bQ62267 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sprr1bQ62267 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sprr1bQ62267 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sprr1bQ62267 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sprr1bQ62267 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sprr1bQ62267 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sprr1bQ62267 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sprr1bQ62267 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sprr1bQ62267 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sprr1bQ62267 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sprr1bQ62267 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sprr1bQ62267 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sprr1bQ62267 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms