Protein–RNA interactions for Protein: Q62217

Sema5a, Semaphorin-5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5aQ62217 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sema5aQ62217 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sema5aQ62217 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sema5aQ62217 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sema5aQ62217 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sema5aQ62217 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sema5aQ62217 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sema5aQ62217 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sema5aQ62217 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sema5aQ62217 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sema5aQ62217 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sema5aQ62217 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sema5aQ62217 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sema5aQ62217 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sema5aQ62217 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sema5aQ62217 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sema5aQ62217 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sema5aQ62217 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sema5aQ62217 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sema5aQ62217 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sema5aQ62217 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sema5aQ62217 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sema5aQ62217 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sema5aQ62217 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sema5aQ62217 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sema5aQ62217 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sema5aQ62217 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sema5aQ62217 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sema5aQ62217 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Sema5aQ62217 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Sema5aQ62217 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sema5aQ62217 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sema5aQ62217 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sema5aQ62217 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sema5aQ62217 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sema5aQ62217 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sema5aQ62217 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Sema5aQ62217 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sema5aQ62217 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sema5aQ62217 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sema5aQ62217 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sema5aQ62217 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sema5aQ62217 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sema5aQ62217 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sema5aQ62217 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sema5aQ62217 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sema5aQ62217 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sema5aQ62217 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sema5aQ62217 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sema5aQ62217 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sema5aQ62217 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema5aQ62217 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema5aQ62217 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema5aQ62217 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema5aQ62217 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema5aQ62217 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema5aQ62217 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sema5aQ62217 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sema5aQ62217 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sema5aQ62217 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema5aQ62217 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema5aQ62217 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema5aQ62217 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema5aQ62217 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sema5aQ62217 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sema5aQ62217 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sema5aQ62217 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sema5aQ62217 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema5aQ62217 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema5aQ62217 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema5aQ62217 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema5aQ62217 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sema5aQ62217 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sema5aQ62217 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema5aQ62217 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema5aQ62217 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema5aQ62217 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema5aQ62217 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema5aQ62217 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sema5aQ62217 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sema5aQ62217 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sema5aQ62217 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema5aQ62217 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema5aQ62217 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema5aQ62217 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema5aQ62217 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema5aQ62217 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sema5aQ62217 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sema5aQ62217 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Sema5aQ62217 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sema5aQ62217 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sema5aQ62217 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sema5aQ62217 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sema5aQ62217 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sema5aQ62217 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sema5aQ62217 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sema5aQ62217 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sema5aQ62217 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sema5aQ62217 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sema5aQ62217 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms