Protein–RNA interactions for Protein: Q62178

Sema4a, Semaphorin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4aQ62178 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema4aQ62178 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema4aQ62178 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema4aQ62178 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema4aQ62178 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema4aQ62178 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema4aQ62178 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema4aQ62178 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema4aQ62178 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema4aQ62178 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema4aQ62178 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema4aQ62178 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema4aQ62178 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema4aQ62178 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema4aQ62178 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema4aQ62178 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema4aQ62178 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema4aQ62178 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema4aQ62178 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema4aQ62178 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema4aQ62178 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema4aQ62178 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema4aQ62178 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema4aQ62178 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema4aQ62178 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema4aQ62178 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema4aQ62178 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema4aQ62178 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema4aQ62178 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema4aQ62178 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema4aQ62178 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema4aQ62178 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema4aQ62178 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema4aQ62178 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema4aQ62178 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema4aQ62178 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema4aQ62178 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema4aQ62178 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema4aQ62178 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema4aQ62178 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema4aQ62178 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema4aQ62178 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema4aQ62178 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema4aQ62178 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema4aQ62178 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema4aQ62178 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema4aQ62178 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema4aQ62178 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema4aQ62178 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema4aQ62178 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema4aQ62178 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema4aQ62178 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema4aQ62178 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema4aQ62178 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema4aQ62178 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema4aQ62178 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema4aQ62178 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema4aQ62178 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema4aQ62178 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema4aQ62178 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema4aQ62178 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema4aQ62178 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema4aQ62178 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema4aQ62178 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema4aQ62178 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema4aQ62178 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema4aQ62178 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema4aQ62178 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema4aQ62178 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema4aQ62178 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema4aQ62178 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema4aQ62178 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema4aQ62178 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema4aQ62178 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Sema4aQ62178 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sema4aQ62178 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema4aQ62178 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema4aQ62178 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema4aQ62178 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema4aQ62178 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema4aQ62178 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema4aQ62178 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema4aQ62178 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema4aQ62178 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema4aQ62178 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema4aQ62178 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema4aQ62178 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema4aQ62178 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema4aQ62178 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema4aQ62178 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema4aQ62178 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema4aQ62178 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema4aQ62178 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema4aQ62178 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema4aQ62178 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema4aQ62178 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema4aQ62178 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema4aQ62178 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema4aQ62178 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema4aQ62178 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms