Protein–RNA interactions for Protein: Q61990

Pcbp2, Poly(rC)-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp2Q61990 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcbp2Q61990 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcbp2Q61990 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcbp2Q61990 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcbp2Q61990 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcbp2Q61990 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcbp2Q61990 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcbp2Q61990 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcbp2Q61990 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcbp2Q61990 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcbp2Q61990 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcbp2Q61990 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcbp2Q61990 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcbp2Q61990 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcbp2Q61990 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcbp2Q61990 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcbp2Q61990 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcbp2Q61990 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcbp2Q61990 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcbp2Q61990 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcbp2Q61990 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcbp2Q61990 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcbp2Q61990 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcbp2Q61990 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcbp2Q61990 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcbp2Q61990 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcbp2Q61990 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcbp2Q61990 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcbp2Q61990 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcbp2Q61990 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcbp2Q61990 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pcbp2Q61990 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pcbp2Q61990 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcbp2Q61990 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcbp2Q61990 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcbp2Q61990 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcbp2Q61990 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcbp2Q61990 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcbp2Q61990 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcbp2Q61990 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcbp2Q61990 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcbp2Q61990 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcbp2Q61990 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcbp2Q61990 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcbp2Q61990 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcbp2Q61990 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcbp2Q61990 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcbp2Q61990 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcbp2Q61990 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcbp2Q61990 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcbp2Q61990 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcbp2Q61990 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcbp2Q61990 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcbp2Q61990 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcbp2Q61990 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcbp2Q61990 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcbp2Q61990 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcbp2Q61990 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcbp2Q61990 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcbp2Q61990 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcbp2Q61990 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcbp2Q61990 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcbp2Q61990 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcbp2Q61990 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcbp2Q61990 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcbp2Q61990 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcbp2Q61990 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcbp2Q61990 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcbp2Q61990 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcbp2Q61990 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcbp2Q61990 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcbp2Q61990 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcbp2Q61990 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcbp2Q61990 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcbp2Q61990 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcbp2Q61990 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcbp2Q61990 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcbp2Q61990 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcbp2Q61990 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcbp2Q61990 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcbp2Q61990 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcbp2Q61990 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcbp2Q61990 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcbp2Q61990 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcbp2Q61990 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcbp2Q61990 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcbp2Q61990 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcbp2Q61990 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcbp2Q61990 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcbp2Q61990 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcbp2Q61990 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcbp2Q61990 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcbp2Q61990 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcbp2Q61990 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcbp2Q61990 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcbp2Q61990 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcbp2Q61990 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcbp2Q61990 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcbp2Q61990 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcbp2Q61990 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.3 ms