Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ctnna2Q61301 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ctnna2Q61301 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ctnna2Q61301 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ctnna2Q61301 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ctnna2Q61301 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ctnna2Q61301 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ctnna2Q61301 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ctnna2Q61301 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ctnna2Q61301 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ctnna2Q61301 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ctnna2Q61301 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ctnna2Q61301 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ctnna2Q61301 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ctnna2Q61301 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ctnna2Q61301 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctnna2Q61301 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctnna2Q61301 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctnna2Q61301 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctnna2Q61301 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ctnna2Q61301 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ctnna2Q61301 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ctnna2Q61301 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ctnna2Q61301 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ctnna2Q61301 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ctnna2Q61301 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ctnna2Q61301 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ctnna2Q61301 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ctnna2Q61301 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ctnna2Q61301 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ctnna2Q61301 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ctnna2Q61301 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ctnna2Q61301 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ctnna2Q61301 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ctnna2Q61301 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ctnna2Q61301 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ctnna2Q61301 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ctnna2Q61301 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ctnna2Q61301 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctnna2Q61301 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctnna2Q61301 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctnna2Q61301 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctnna2Q61301 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctnna2Q61301 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctnna2Q61301 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctnna2Q61301 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctnna2Q61301 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctnna2Q61301 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctnna2Q61301 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctnna2Q61301 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ctnna2Q61301 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ctnna2Q61301 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ctnna2Q61301 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ctnna2Q61301 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ctnna2Q61301 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ctnna2Q61301 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ctnna2Q61301 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ctnna2Q61301 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ctnna2Q61301 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctnna2Q61301 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctnna2Q61301 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctnna2Q61301 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctnna2Q61301 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctnna2Q61301 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctnna2Q61301 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctnna2Q61301 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctnna2Q61301 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctnna2Q61301 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctnna2Q61301 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctnna2Q61301 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctnna2Q61301 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctnna2Q61301 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctnna2Q61301 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctnna2Q61301 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ctnna2Q61301 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ctnna2Q61301 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ctnna2Q61301 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ctnna2Q61301 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ctnna2Q61301 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ctnna2Q61301 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ctnna2Q61301 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctnna2Q61301 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctnna2Q61301 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctnna2Q61301 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctnna2Q61301 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctnna2Q61301 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctnna2Q61301 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctnna2Q61301 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctnna2Q61301 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctnna2Q61301 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctnna2Q61301 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctnna2Q61301 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctnna2Q61301 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctnna2Q61301 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ctnna2Q61301 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ctnna2Q61301 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ctnna2Q61301 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ctnna2Q61301 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctnna2Q61301 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctnna2Q61301 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms