Protein–RNA interactions for Protein: Q61187

Tsg101, Tumor susceptibility gene 101 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsg101Q61187 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tsg101Q61187 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tsg101Q61187 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tsg101Q61187 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tsg101Q61187 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tsg101Q61187 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tsg101Q61187 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tsg101Q61187 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tsg101Q61187 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Tsg101Q61187 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tsg101Q61187 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tsg101Q61187 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tsg101Q61187 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tsg101Q61187 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tsg101Q61187 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Tsg101Q61187 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tsg101Q61187 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tsg101Q61187 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tsg101Q61187 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tsg101Q61187 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tsg101Q61187 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tsg101Q61187 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tsg101Q61187 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tsg101Q61187 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tsg101Q61187 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tsg101Q61187 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tsg101Q61187 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tsg101Q61187 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tsg101Q61187 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tsg101Q61187 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Tsg101Q61187 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tsg101Q61187 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tsg101Q61187 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tsg101Q61187 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tsg101Q61187 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tsg101Q61187 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tsg101Q61187 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tsg101Q61187 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tsg101Q61187 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tsg101Q61187 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tsg101Q61187 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tsg101Q61187 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tsg101Q61187 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tsg101Q61187 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tsg101Q61187 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tsg101Q61187 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tsg101Q61187 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Tsg101Q61187 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tsg101Q61187 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tsg101Q61187 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tsg101Q61187 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tsg101Q61187 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tsg101Q61187 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tsg101Q61187 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tsg101Q61187 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tsg101Q61187 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tsg101Q61187 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tsg101Q61187 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tsg101Q61187 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tsg101Q61187 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tsg101Q61187 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tsg101Q61187 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tsg101Q61187 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tsg101Q61187 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tsg101Q61187 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tsg101Q61187 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tsg101Q61187 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tsg101Q61187 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tsg101Q61187 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tsg101Q61187 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Tsg101Q61187 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tsg101Q61187 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tsg101Q61187 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tsg101Q61187 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tsg101Q61187 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tsg101Q61187 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tsg101Q61187 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tsg101Q61187 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tsg101Q61187 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tsg101Q61187 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tsg101Q61187 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tsg101Q61187 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tsg101Q61187 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tsg101Q61187 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tsg101Q61187 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tsg101Q61187 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tsg101Q61187 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tsg101Q61187 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tsg101Q61187 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tsg101Q61187 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tsg101Q61187 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tsg101Q61187 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tsg101Q61187 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tsg101Q61187 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tsg101Q61187 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Tsg101Q61187 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Tsg101Q61187 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tsg101Q61187 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tsg101Q61187 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tsg101Q61187 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms