Protein–RNA interactions for Protein: Q60960

Kpna1, Importin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna1Q60960 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kpna1Q60960 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kpna1Q60960 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kpna1Q60960 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kpna1Q60960 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kpna1Q60960 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kpna1Q60960 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kpna1Q60960 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kpna1Q60960 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kpna1Q60960 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kpna1Q60960 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kpna1Q60960 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kpna1Q60960 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kpna1Q60960 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kpna1Q60960 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kpna1Q60960 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kpna1Q60960 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Kpna1Q60960 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kpna1Q60960 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kpna1Q60960 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kpna1Q60960 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kpna1Q60960 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kpna1Q60960 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kpna1Q60960 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kpna1Q60960 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Kpna1Q60960 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kpna1Q60960 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kpna1Q60960 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kpna1Q60960 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kpna1Q60960 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kpna1Q60960 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kpna1Q60960 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kpna1Q60960 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kpna1Q60960 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kpna1Q60960 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kpna1Q60960 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kpna1Q60960 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kpna1Q60960 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kpna1Q60960 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kpna1Q60960 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kpna1Q60960 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kpna1Q60960 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kpna1Q60960 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kpna1Q60960 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kpna1Q60960 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Kpna1Q60960 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kpna1Q60960 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kpna1Q60960 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Kpna1Q60960 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kpna1Q60960 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kpna1Q60960 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kpna1Q60960 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kpna1Q60960 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kpna1Q60960 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kpna1Q60960 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kpna1Q60960 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kpna1Q60960 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Kpna1Q60960 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kpna1Q60960 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kpna1Q60960 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kpna1Q60960 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kpna1Q60960 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kpna1Q60960 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kpna1Q60960 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kpna1Q60960 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kpna1Q60960 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kpna1Q60960 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kpna1Q60960 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Kpna1Q60960 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Kpna1Q60960 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kpna1Q60960 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kpna1Q60960 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kpna1Q60960 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kpna1Q60960 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kpna1Q60960 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kpna1Q60960 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kpna1Q60960 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kpna1Q60960 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kpna1Q60960 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kpna1Q60960 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Kpna1Q60960 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kpna1Q60960 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kpna1Q60960 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kpna1Q60960 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kpna1Q60960 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kpna1Q60960 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kpna1Q60960 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kpna1Q60960 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Kpna1Q60960 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kpna1Q60960 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kpna1Q60960 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kpna1Q60960 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kpna1Q60960 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Kpna1Q60960 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kpna1Q60960 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kpna1Q60960 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Kpna1Q60960 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kpna1Q60960 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kpna1Q60960 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kpna1Q60960 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms